-
دسترسی آزاد مقاله
1 - بررسی تئوری برهمکنش های بین بخش های حلقوی بعضی از داروها با نوکلئیک اسیدهای گوانین و آدنین: روش DFT، آنالیز AIM و محاسبات NBO
حسین عزیزی توپکانلو ضحی رحمانیروش تابعی چگال (DFT)، اتم در مولکول و روش NBO برای بررسی برهمکنش های π-π بین بخش های مختلف دارویی حلقوی شامل ایندول(I) ، بنزوتیوفن (Bt) و بنزوفوران(Bf) با گوانین (G) و آدنین (A) بکار گرفته شد. چندین کنفورمرمختلف از کمپلکس های تشکیل شده بین بخش های مختلف دارویی با چکیده کاملروش تابعی چگال (DFT)، اتم در مولکول و روش NBO برای بررسی برهمکنش های π-π بین بخش های مختلف دارویی حلقوی شامل ایندول(I) ، بنزوتیوفن (Bt) و بنزوفوران(Bf) با گوانین (G) و آدنین (A) بکار گرفته شد. چندین کنفورمرمختلف از کمپلکس های تشکیل شده بین بخش های مختلف دارویی با گوانین و آدنین توسط تابع M062X/6-311++G(d,p) بهینه شدند. نتایج نشان داد که کنفورمر IG1 و IA6 بیشترین پایداری را در بین تمام کنفورمرهای گوانین و آدنین دارند و ترتیب پایداری ها برای کمپلکس های گوانین به صورت IG1 > BtG6 > BfG1 و همچنین برای کمپلکس های آدنین به صورت IA6 > BtA6 > BfG6 می باشد. به علاوه، بررسی ما نشان داد که نتایج حاصل از روش DFT کاملا در تطابق با نتایج بدست آمده از آنالیز AIM می باشد. اما برعکس ارتباط مناسبی بین نتایج AIM و NBO مشاهده نگردید. پرونده مقاله -
دسترسی آزاد مقاله
2 - بررسی نظری ترکیب 2-سلنوفرمیل3-تیوکسو پروپیونالدهید (STP) در حالات برانگیخته یکتایی و سهتایی
رامین رفعت علیرضا نوروزیدر مطالعه حاضر، تاتومری، قدرت پیوند هیدروژنی و عدم استقرار الکترونهای π در حالات برانگیخته یکتایی و سهتایی ترکیب 2-سلنوفرمیل3-تیوکسو پروپیونالدهید(STP) مورد بررسی قرار گرفته است. ابتدا تمامی همصورتهای حاوی پیوند هیدروژنی در حالتهای برانگیخته توسط روشهای CIS و T چکیده کاملدر مطالعه حاضر، تاتومری، قدرت پیوند هیدروژنی و عدم استقرار الکترونهای π در حالات برانگیخته یکتایی و سهتایی ترکیب 2-سلنوفرمیل3-تیوکسو پروپیونالدهید(STP) مورد بررسی قرار گرفته است. ابتدا تمامی همصورتهای حاوی پیوند هیدروژنی در حالتهای برانگیخته توسط روشهای CIS و TD-DFT با مجموعه پایه 6-311++G(d,p) بهینه شدهاند. نتایج انرژیهای نسبی نشان میدهند که همصورتهای تیول و انول به ترتیب پایدارترین و ناپایدارترینها میباشند. همچنین، انرژیهای الکترونی نشان میدهند که تمامی ساختارها در حالت برانگیخته سهتایی نسبت به یکتایی پایدارتر هستند. از آنجاکه این همصورتها به سیستمهای پیوند هیدروژنی یاری شده با رزونانس تعلق دارند، میتوان علت پایداری بیشتر همصورتهای تیول را در یکی از موارد تاتومریسم، قدرت پیوند هیدروژنی و اثرات عدم استقرار الکترونهای π جستجو کرد. انرژیهای تاتومری از نظر ترمودینامیکی بیانگر پایداری بیشتر تاتومر تیول نسبت به انول و سلنول در تمامی حالات برانگیخته هستند. بعلاوه، انرژیهای فعال سازی بدست آمده نشان میدهند که تعادل تاتومری تیو⇋تیول در تمامی سطوح محاسباتی از نظر سنتیکی نسبت به سایر تعادلات ارجح است. پیوندهای هیدروژنی که با استفاده از توصیفگرهای متفاوت مورد بررسی قرار گرفتهاند، بر قوی تر بودن پیوندهای هیدروژنی درون ملکولی در همصورتهای انولی تاکید دارند. بعلاوه، ارزیابیهای عدم استقرار الکترونی نیز نشان دهنده مقدار بیشتر آن در همصورتهای انولی میباشند. از آنجاکه، نتایج حاصل از تحلیل پیوند هیدروژنی و عدم استقرار الکترونی با روند پایداری همصورتها مطابقت ندارد، نهایتا میتوان نتیجه گرفت که در این همصورتها، فرآیند تاتومریسم عامل غالب در تعیین پایداری میباشد. پرونده مقاله -
دسترسی آزاد مقاله
3 - Tautomeric equilibria for ionized oxamic acid - inhibitor of LDH
Ewa D. Raczyńska Małgorzata Hallmann Kinga DuczmalAmide-iminol tautomerism was studied for ionized oxamic acid (OA+•) in the gas phase using theDFT method with the UB3LYP functional and various basis sets {6-31++G(d,p), 6-311+G(d,p), and augcc-pVDZ}. Among twenty tautomers-rotamers possible for OA+•, eleven i چکیده کاملAmide-iminol tautomerism was studied for ionized oxamic acid (OA+•) in the gas phase using theDFT method with the UB3LYP functional and various basis sets {6-31++G(d,p), 6-311+G(d,p), and augcc-pVDZ}. Among twenty tautomers-rotamers possible for OA+•, eleven isomers were found to bethermodynamically stable. Similarly as for the neutral molecule, ionization (OA → OA+• + e) favors theamidization process (amide ← iminol). Isomerization seems to change solely the conformationalpreferences. π-Electron delocalization in the NCO and OCO moieties is close to that for n-π conjugatedfragments. پرونده مقاله