بررسی روش های مختلف برای شناسایی ژنوتیپ های گونه های جنس Armillaris (قارچ عسلی)
محورهای موضوعی : زیست شناسی سلولی تکوینی گیاهی و جانوری ، تکوین و تمایز ، زیست شناسی میکروارگانیسم
1 - گروه زیست شناسی، دانشکده علوم زیستی،دانشگاه آزاد اسلامی واحد تهران شمال، تهران، ایران
کلید واژه: RFLP, RAPD, گونه های جنس Armillaris, الل های تیپ-آمیزشی,
چکیده مقاله :
هدف از مطالعه اخیر مقایسه SI با استفاده از سه روش دیگر برای تمایز ژنوتیپ ها است که عبارتند از: روش چند شکلی قطعات DNA حاصل از تکثیر تصادفی (RAPD)، بررسی الل های تیپ-آمیزشی و آنالیز ایزوآنزیم ها RAPD و الل های تیپ-آمیزشی در 73 ایزوله، که متعلق به 36 ژنوتیپ شناسایی شده بر اساس آنالیز بودند، مورد استفاده قرار گرفتند. بررسی تعداد محدودی از ایزوله ها با استفاده از پلی مورفیسم ایزوآنزیم انجام شد. RAPDs، الل های تیپ آمیزشی و SI در هر سه مورد ایزوله های تمایز یافته از طریق واکنش های SI شامل دو زیرگروه با فنوتیپ های RAPD متفاوت بودند. در دو مورد گروه های تمایز یافته از طریق واکنش های SI مجموعه مشابهی از الل های تیپ آمیزشی را به اشتراک گذاشتند. آنالیز ایزوآنزیم نشان دهنده تفاوت های بین گونه ای و تفاوت های ناچیز بین ژنوتیپ های یک گونه یکسان بود. این یافته ها باعث شده تا استفاده از SI به عنوان روشی روتین و معتبر برای مطالعات اپیدمیولوژیک گونه های Armillaria در نظر گرفته شود.در گروه یکسانی از ایزوله ها، پروفایل های قطعه EcoR I مربوط به DNA میتوکندری نیز بررسی شدند. این آنالیز ژنوتیپ ها را مجددا در ’تیپ های میتوکندریایی‘ گروه بندی کرد که سیتوپلاسم معمولی را به اشتراک گذاشته و احتمالا از طریق تولید مثل جنسی ارتباط نزدیکی با یکدیگر دارند.
The purpose of the recent study is to compare SI with three other methods for distinguishing genotypes, which are: DNA fragment polymorphism method resulting from random multiplication (RAPD), investigation of mixed-type alleles and analysis of RAPD isoenzymes and type-type alleles. A mixture of 73 isolates, belonging to 36 genotypes identified based on the analysis, were used. A limited number of isolates were investigated using isozyme polymorphism. RAPDs, mixed-type alleles and SI in all three cases of isolates differentiated through SI reactions included two subgroups with different RAPD phenotypes.In two cases, the groups differentiated through SI reactions shared a similar set of alleles of the mixing type. Isoenzyme analysis showed interspecies differences and insignificant differences between genotypes of the same species. These findings have led to consider the use of SI as a routine and valid method for epidemiological studies of Armillaria species.In the same group of isolates, profiles of the EcoR I fragment related to mitochondrial DNA were also investigated. This analysis regrouped the genotypes into 'mitochondrial types' that share common cytoplasm and are likely closely related through sexual reproduction.
_||_