آنالیز فیلوژنتیک مایکوباکتریوم آویوم تحتگونه پاراتوبرکلوزیس جدا شده از گاوداریهای استان تهران
محورهای موضوعی : آسیب شناسی درمانگاهی دامپزشکی
بهبود جعفری
1
(
دانشآموخته، گروه میکروبیولوژی، دانشکده دامپزشکی، واحد علوم و تحقیقات، دانشگاه آزاد اسلامی، تهران، ایران.
)
محمود جمشیدیان
2
(
استاد، گروه میکروبیولوژی، دانشکده دامپزشکی، واحد علوم و تحقیقات، دانشگاه آزاد اسلامی، تهران، ایران.
)
فرهاد موسی خانی
3
(
استادیار، گروه میکروبیولوژی، دانشکده دامپزشکی، واحد کرج، دانشگاه آزاد اسلامی،کرج، ایران.
)
کلید واژه: تهران, مایکوباکتریوم آویوم تحتگونه پاراتوبرکلوزیس, آنالیز فیلوژنتیک,
چکیده مقاله :
بیماری یون یا پاراتوبرکلوزیس نوعی التهاب روده شدید، مزمن و پیش رونده در نشخوارکنندگان با عامل مسبب مایکوباکتریوم آویوم تحت گونه پاراتوبرکلوزیس می باشد که خسارات اقتصادی فراوانی به صنعت دامپروری به ویژه گاوداری های شیری وارد می کند. از سوی دیگر آن را عامل ایجاد کننده بیماری کرون در انسان می شناسند. این مطالعه با هدف آنالیز فیلوژنتیک مایکوباکتریوم پاراتوبرکلوزیس جداشده از گاوداری های استان تهران انجام گردید. در این مطالعه از تعداد 100 نمونه مدفوع گاوهای مشکوک به بیماری یون، استخراج DNAانجام شد سپس با استفاده از پرایمرهای اختصاصی ژن IS900واکنش Nested PCRصورت گرفت و از موارد مثبت جدا شده، 14 نمونه به طور تصادفی برای توالی یابی به شرکت ماکروژن کره ارسال گردید. در این مطالعه در مجموع 28 نمونه از 100 نمونه مدفوعی از نظر وجود باکتری مایکوباکتریوم آویوم تحت گونه پاراتوبرکلوزیس مثبت بود. بعد از توالی یابی نمونههای مثبت ملاحظه گردید که بیش از 99 درصد با توالی های موجود در بانک ژن شباهت وجود دارد. همچنین نتایج مطالعه حاضر نشان داد که سویه های KJ629114 وAE016958 بیشترین شباهت و سویه CP000325 بیشترین تفاوت را با جدایه های حاصل از این مطالعه در ژن GyrAدارند. در مورد ژن GyrBنیز بیشترین شباهت مربوط به سویه های AE016985 ،CP005928 وCP009614 و بیشترین تفاوت هم مربوط به سویه GU143884می باشد. نتایج مطالعه نشان داد که تکنیک Nested PCRمی تواند روش ارزشمندی برای شناسایی مایکوباکتریوم آویوم تحت گونه پاراتوبرکلوزیس در حیوانات باشد.
Paratuberculosis or Johne's disease is a severe chronic and progressive intestinal inflammation in ruminants caused by Mycobacterium avium subspecies paratuberculosis which can lead to great economic losses to the livestock industry especially dairy idustry. On the other hand, it is known as a zoonosis in the pathogenesis of Crohn's disease in humans. This study was conducted with the purpose of phylogenetic analysis of Mycobacterium avium par tuberculosis isolated from dairies in Tehran. In this study, DNA extraction was performed on 100 stool samples from Johne's disease infected cattle. Then using specific primers of gene IS900, Nested PCR reactions was carried out and from the positive samples isolated, 14 cases were randomly selected and sent to Macro gene Company in Korea for sequencing. In this study, 28 samples from a total of 100 stool samples were positive for MAP. After sequencing, more than 99% of the positive samples were similar with sequences in gene bank. The Results showed that Nested PCR technique can be a valuable test for detection of Mycobacterium avium paratuberculosis in animals. The sequencing results indicated that strains KJ629114 and AE016958 had the highest similarity and CP000325 had the highest difference in GyrA gene. In regard to GyrB gene, the highest similarity belongs to strains AE016985, CP005928 and CP009614 and the highest difference was related to GU143884.