شناسایی اکتینومیستهای خاک و اثرات آنها در زیتون (Olea europea L.) رقم کنسروالیا
محورهای موضوعی : میکروب شناسی
پروین باقری
1
(کارشناسی ارشد، گروه میکروبیولوژی، واحد قم، دانشگاه آزاد اسلامی، قم، ایران)
فرح فراهانی
2
(دانشیار، گروه میکروبیولوژی، واحد قم، دانشگاه آزاد اسلامی، قم، ایران)
سید سهیل آقائی
3
(استادیار، گروه میکروبیولوژی، واحد قم، دانشگاه آزاد اسلامی، قم، ایران)
کلید واژه: استرپتومیست, زیتون رقم کنسروالیا, اکتینومیستها, ریزوباکترها,
چکیده مقاله :
هدف: اکتینومیستها برای بیوکنترل علیه قارچهای خاک مفید و در برخی از گیاهان زراعی رشد دانه، وزن بوته و عملکرد را افزایش میدهند. در این مطالعه جداسازی، شناسایی و بررسی جمعیت گونههای استرپتومیست خاک کشاورزی منطقه Cباغ فدک و تاثیر بر رشد دانه رستهای زیتون (Olea europea L.) رقم کنسروالیا مورد بررسی قرار گرفت. مواد و روشها: در این پژوهش جداسازی اکتینومیستها از خاک منطقهC انجام شد، سپس غربالگری اولیه، کشت و غربالگری ثانویه با انتشار در آگار و استخراج DNA و تأثیر بر رشد دانه رستهای زیتون رقم کنسروالیا انجام گرفت. شناسایی مولکولی DNA برای تمام جدایهها انجام و ژن rRNA 16s آنها با واکنش PCR تکثیر و نمونههای مثبت، سکانس شدند. نتایج حاصل از آنالیزهای فیلوژنتیکی تمام سکانسهای ثبت شده این ژن، از بانک اطلاعاتی NCBI دانلود شدند و برای بررسی فیلوژنتیکی با نرمافزار Mega 7 با فرمت FAST A ذخیره گردید. تمام سکانس جداسازی، شناسایی و بررسی جمعیت گونههای استرپتومیستها وارد نرمافزار گردید. یافتهها: از خاک منطقهC باغ فدک 40 باکتری اکتینومیست جداسازی شدند. با انجام تستهای اختصاصی، جدایههای استرپتومیست مورد شناسایی قرار گرفتند. تستهای بیوشیمیایی و مورفولوژیکی (ظاهر رشتهای و سفید) بر روی 5 جدایه، وجود استرپتومیستها را تایید نمودند. جدایهها با تولید اکسین، در افزایش ریشهزایی دانه رستهای زیتون رقم کنسروالیا موثر بودند. ظرفیت ریشهزایی جدایه D استرپتومیست از نظر آماری معنیدار بود (سطح احتمال 05/0). نتیجهگیری: استرپتومیستهای خاکهای کشاورزی، بر ریشهزایی درختان موثر هستند.
Objective: Actinomycetes are useful for biocontrol against soil fungi and increase seed growth, plant weight and yield in some crops. In this study, the isolation, identification and investigation of the population of Streptomyces species in the agricultural soil of C Bagh Fadak area and the effect on the seed growth of olive (Olea europea L.) cultivar Conservalia were investigated. Materials and methods: In this study, actinomycetes were isolated from the soil of region C, then primary screening, culture and secondary screening were done by diffusion in agar and DNA extraction and the effect on seed growth of conservalia cultivar olives. DNA molecular identification was done for all the isolates andtheir rRNA 16s genes were amplified by PCR reaction and the positive samples were sequenced. The results of phylogenetic analyzes of all recorded sequences of this gene were downloaded from the NCBI database and saved for phylogenetic analysis with Mega 7 software in FAST A format. The whole sequence of isolating, identifying and checking the population of Streptomyces species was entered into the software. Findings: 40 actinomycete bacteria were isolated from the soil of area C of Fadak garden. By performing specific tests, Streptomyces isolates were identified. Biochemical and morphological tests (stringy and white appearance) on 5 isolates confirmed the presence of streptomycetes. By producing auxin, the isolates were effective in increasing the rooting of Conservalia cultivar olive seeds. The rooting capacity of Streptomyces isolate D was statistically significant (probability level 0.05). Conclusion: Streptomyces of agricultural soils are effective on tree rooting.
DOI: https://doi.org/10.1016/j.soilbio.2009.11.024
DOI: https://doi.org/10.1016/j.sajb.2016.03.020
2558–2564. DOI: https://doi.org/10.5897/AJB2013.11945.
DOI: https://doi.org/10.1099/ijs.0.02624-0
_||_
DOI: https://doi.org/10.1016/j.soilbio.2009.11.024
DOI: https://doi.org/10.1016/j.sajb.2016.03.020
2558–2564. DOI: https://doi.org/10.5897/AJB2013.11945.
DOI: https://doi.org/10.1099/ijs.0.02624-0