بررسی فیلوژنیک ویروس طاعون نشخوار کنندگان کوچک شناسایی شده در دام های مبتلا در خراسان رضوی بر اساس دو ژن F و N
محورهای موضوعی :
ویروس شناسی
جواد انصاری
1
,
افشین رئوفی
2
,
امید مددگار
3
,
حمید رضا ورشویی
4
,
سعید بکایی
5
1 - گروه بیماریهای داخلی، دانشکده دامپزشکی دانشگاه تهران، تهران
2 - استاد گروه بیماریهای داخلی.دانشکده دامپزشکی. دانشگاه تهران. تهران .ایران
3 - دانشیار گروه میکروبیولوژی و ایمونولوژی دانشکده دامپزشکی دانشگاه تهران، تهران
4 - استادیار موسسه تحقیقات واکسن و سرم سازی رازی
5 - استادگروه بهداشت مواد غذایی، دانشکده دامپزشکی دانشگاه تهران، تهران، ایران
تاریخ دریافت : 1398/06/04
تاریخ پذیرش : 1398/12/08
تاریخ انتشار : 1400/12/01
کلید واژه:
خراسان رضوی,
تشخیص مولکولی,
ویروس طاعون نشخوار کننده کوچک,
گوسفند,
بز,
چکیده مقاله :
بیماری طاعون نشخوار کنندگان کوچک یک بیماری ویروسی بسیار واگیردار، کشنده و وخیم در نشخوار کننده کوچک می باشد. عامل بیماری، ویروس طاعون نشخوار کننده کوچک بوده(Peste des petits ruminants virus ) که در جنس موربیلی ویروس قرار دارد. مطالعه حاضر جهت تعیین هویت ژنتیکی ویروس طاعون نشخوار کننده کوچک(PPRV) در حال گردش در استان خراسان رضوی انجام شد. اخیرا گزارشات متعددی از حضور بیماری در خراسان رضوی موجود است. در مطالعه پیش رو تعداد 100 نمونه (خون، طحال و غدد لمفاوی) از دام های دارای علائم بالینی و تلف شده تهیه گردید. کلیه نمونه ها از نظر حضور ژن های نوکلئوکپسید (N) و فیوژن (F)و با روش RT-PCR مورد ارزیابی قرار گرفته و همه ی نمونه های مورد آزمون مثبت گزارش شدند. تعداد هفت نمونه از موارد مثبت به طور تصادفی انتخاب شده و جهت تعیین توالی ژن های N و F ارسال گردید. به طور کلی براساس آنالیز فیلوژنتیکی توالی ژن های N و F، ویروس طاعون نشخوار کننده کوچک به چهار دودمان تقسیم می شود. پس از تعیین هویت و آنالیز سکانس ژن های F و N و مقایسه آن با سایر سویه های موجود در بانک ژنی، برای هر ژن به طور مجزا درخت فیلو ژنتیکی رسم گردید. با اینکه هر یک از درخت های رسم شده برای ژن N و یا F دارای دو خوشه مجزا و زیر خوشه های متفاوت بودند اما کلیه سویه های مورد آزمون در دودمان چهار قرار گرفتند.
منابع و مأخذ:
Abdollahpour, G., Raoofi, A., Najafi, J., Sasani, F., & Sakhaie, E. (2006). Clinical and Para‐clinical Findings of a Recent Outbreaks of Peste des Petits Ruminants in Iran. Journal of Veterinary Medicine, Series B, 53: 14-16.
Abraham, G., Sintayehu, A., Libeau, G., Albina, E., Roger, F., Laekemariam, Y., . . . Awoke, K. (2005). Antibody seroprevalences against peste des petits ruminants (PPR) virus in camels, cattle, goats and sheep in Ethiopia. Preventive veterinary medicine, 70: 51-57.
Abubakar, , Jamal, S. M., Hussain, M., & Ali, Q. (2008). Incidence of peste des petits ruminants (PPR) virus in sheep and goat as detected by immuno-capture ELISA (Ic ELISA). Small ruminant research, 75: 256-259.
Adombi, C. M., Lelenta, M., Lamien, C. E., Shamaki, D., Koffi, Y. M., Traoré, A., . . . Djaman, J. A. (2011). Monkey CV1 cell line expressing the sheep–goat SLAM protein: a highly sensitive cell line for the isolation of peste des petits ruminants virus from pathological specimens. Journal of virological methods, 173: 306-313.
Al-Dubaib, M. A. (2008). Prevalence of Peste despetitis ruminants Infection in Sheep and Goat Farms at the Central Region of Saudi Arabia. Research journal of Veterinary Sciences, 1: 67-70.
Alemu, B., Gari, G., Libeau, G., Kwiatek, O., Kidane, M., Belayneh, R., . . . Abdi, R. D. (2019). Molecular detection and phylogenetic analysis of Peste des petits ruminants virus circulating in small ruminants in easternAmhara region, Ethiopia. BMC veterinary research, 15: 1-9.
Ali, W. H., Osman, N. A., Asil, R. M., Mohamed, B. A., Abdelgadir, S. O., Mutwakil, S. M., & Mohamed, N. E. (2018). Serological investigations of peste des petits ruminants among cattle in theSudan. Tropical Animal Health and Production, 51: 655-659.
Al-Naeem, A., Abu Elzein, E. M., & Al-Afaleq, A. I. (2000). Epizootiological aspects of peste des petits ruminants and rinderpest in sheep and goats in Saudi Arabia. Rev Sci Tech, 19 :855-858.
Baazizi, R., Mahapatra, M., Clarke, B. D., Ait-Oudhia, K., Khelef, D., & Parida, S. (2017). Peste des petits ruminants (PPR): A neglected tropical disease in Maghreb region of North Africa and its threat to Europe. PloS one, 12 : e0175461.
Balamurugan, V., Krishnamoorthy, P., Veeregowda, B. M., Sen, A., Rajak, K. K., Bhanuprakash, V., . . . Prabhudas, K. (2012). Seroprevalence of Peste des petits ruminants in cattle and buffaloes from Southern Peninsular India. Tropical Animal Health and Production, 44 : 301-306.
Banyard, A. C., Parida, S., Batten, C., Oura, C., Kwiatek, O., & Libeau, G. (2010). Global distribution of peste des petits ruminants virus and prospects for improved diagnosis and control. Journal of general virology, 91 : 2885-2897..
Banyard, A. C., Wang, Z., & Parida, S. (2014). Peste des petits ruminants virus, Eastern Asia. Emerging infectious diseases, 20 : 2176.
Baron, M. D., Diop, B., Njeumi, F., Willett, B. J., & Bailey, D. (2017). Future research to underpin successful peste des petits ruminants virus (PPRV) eradication. The Journal of general virology, 98 : 2635.
Bazarghani, T. T., Charkhkar, S., Doroudi, J., & Bani Hassan, E. (2006). A review on peste des petits ruminants (PPR) with special reference to PPR in Iran. Journal of Veterinary Medicine, Series B, 53: 17-18.
Davari, S. A., Sayyari, M., & Mohammadi, A. (2013). Genetic analysis of the viral agents causing muzzle crust in small ruminants of Shiraz, Iran. Bulgarian Journal of Veterinary Medicine, 16:159−169.
Couacy-Hymann, E., Roger, F., Hurard, C., Guillou, J., Libeau, G., & Diallo, A. (2002). Rapid and sensitive detection of peste des petits ruminants virus by a polymerase chain reaction assay. Journal of virological methods, 100: 17-25.
Dhar, P., Sreenivasa, B., Barrett, T., Corteyn, M., Singh, R., & Bandyopadhyay, S. (2002). Recent epidemiology of peste des petits ruminants virus (PPRV). Veterinary microbiology, 88: 153-159.
Diallo, A., Minet, C., Le Goff, C., Berhe, G., Albina, E., Libeau, G., & Barrett, T. (2007). The threat of peste des petits ruminants: progress in vaccine development for disease control. Vaccine, 25: 5591-5597.
Elzein, E. A., Housawi, F., Bashareek, Y., Gameel, A., Al‐Afaleq, A., & Anderson, E. (2004). Severe PPR Infection in Gazelles kept under semi‐free range conditions. Journal of Veterinary Medicine, Series B, 51 : 68-71.
EFSA Panel on Animal Health and Welfare. (2014). Scientific opinion on sheep and goat pox. EFSA Journal, 12:
Esmaelizad, M., Jelokhani-Niaraki, S., & Kargar-Moakhar, R. (2011). Phylogenetic analysis of peste des petits ruminants virus (PPRV) isolated in Iran based on partial sequence data from the fusion (F) protein gene. Turkish Journal of Biology, 35: 45-50.
Farougou, S., Gagara, M., & Mensah, G. A. (2013). Prevalence of peste des petits ruminants in the arid zone in the Republic of Niger. Onderstepoort Journal of Veterinary Research, 80 : 1-6.
Forsyth, M., & Barrett, T. (1995). Evaluation ofpolymerase chain reaction for the detection and characterisation of rinderpest and peste des petits ruminants viruses for epidemiological studies. Virus research, 39 : 127-136.
Gibbs, P. J., Taylor, W. P., Lawman, M. J., & Bryant, J. (1979). Classification of peste des petits ruminants virus as the fourth member of the genus Morbillivirus. Intervirology, 11: 268-274.
Güler, L., Şevik, M., & Hasöksüz, M. (2014). Phylogenetic analysis of peste des petits ruminants virus from outbreaks in Turkey during 2008-2012. Turkish Journal of Biology, 38 : 671-678.
Ismail, T. M., Hassas, H. B., Nawal, M., Rakha, G. M., Abd El-Halim, M. M., & Fatebia, M. M. (1992). Studies on prevalence of rinderpest and peste des petits ruminants antibodies in camel sera in Egypt. Veterinary Medical Journal Giza, 10 : 49-53.
Kerdiles, Y. M., Cherif, B., Marie, J. C., Tremillon, N., Blanquier, B., Libeau, G., . . . Horvat, B. (2006). Immunomodulatory properties of morbillivirus nucleoproteins. Viral immunology, 19 : 324-334.
Kerur, N., Jhala, M., & Joshi, C. (2008). Genetic characterization of Indian peste des petits ruminants virus (PPRV) by sequencing and phylogenetic analysis of fusion protein and nucleoprotein gene segments. Research in veterinary science, 85: 176-183.
Kul, O., Atmaca, H. T., & Munir, M. (2015). Pathology of peste des petits ruminants virus infection in small ruminants and concurrent infections Peste des Petits Ruminants Virus: Springer, Berlin, Heidelberg : 119-131.
Kumar, K. S., Babu, A., Sundarapandian, G., Roy, P., Thangavelu, A., Kumar, K. S., . . . Mahapatra, M. (2014). Molecular characterisation of lineage IV peste des petits ruminants virus using multi gene sequence data. Veterinary microbiology, 174 : 39-49.
Kumar, S., Stecher, G., & Tamura, K. (2016). MEGA7: molecular evolutionary genetics analysis version 7.0 for bigger datasets. Molecular biology and evolution, 33: 1870-1874.
Kwiatek, O., Minet, C., Grillet, C., Hurard, C., Carlsson, E., Karimov, B., . . . Libeau, G. (2007). Peste des petits ruminants (PPR) outbreak in Tajikistan. Journal of comparative pathology, 136 : 111-119.
Lefever, P., & Diallo, A. (1990). Peste des petits ruminants virus. Sci. Tech. Off. Int. Epiz, 9 : 935-981.
Lembo, T., Oura, C., Parida, S., Hoare, R., Frost, L., Fyumagwa, R., . . . Cleaveland, S. (2013). Peste des petits ruminants infection among cattle and wildlife in northern Tanzania. Emerging infectious diseases, 19: 2037.
Mahamat, O., Doungous, T., Kebkiba, B., Oumar, H. A., Oussiguéré, A., Yacoub, A. H., . . . Moussa, A. H. (2018). Seroprevalence, geographical distribution, and risk factors of peste des petits ruminants in the Republic of Chad. Journal of Advanced Veterinary and Animal Research, 5 : 420.
Mondal, B., Sreenivasa, B., Dhar, P., Singh, R., & Bandyopadhyay, S. (2001). Apoptosis induced by peste des petits ruminants virus in goat peripheral blood mononuclear cells. Virus research, 73 : 113-119.
Munir, , Zohari, S., & Berg, M. (2012). Molecular biology and pathogenesis of peste des petits ruminants virus: Springer Science & Business Media.
Munir, M., Zohari, S., Saeed, A., Khan, Q., Abubakar, M., LeBlanc, N., & Berg, M. (2012). Detection and phylogenetic analysis of peste des petits ruminants virus isolated from outbreaks in Punjab, Pakistan. Transboundary and emerging diseases, 59 : 85-93.
Munir, M. (2014). Role of wild small ruminants in the epidemiology of peste des petits ruminants. Transboundary and emerging diseases, 61: 411-424.
Muthuchelvan, D., Sanyal, A., Sreenivasa, B., Saravanan, P., Dhar, P., Singh, R., . . . Bandyopadhyay, S. (20). Analysis of the matrix protein gene sequence of the Asian lineage of peste-des-petits ruminants vaccine virus. Veterinary microbiology, 113 : 83-87.
OIE, A. (2008). Manual of diagnostic tests and vaccines for terrestrial animals. Office international des epizooties, paris, France.
Parida, S., Muniraju, M., Mahapatra, M., Muthuchelvan, D., Buczkowski, H., & Banyard, A. (2015). Peste des petits ruminants. Veterinary microbiology, 181 : 90-106.
Rajak, K., Sreenivasa, B., Hosamani, , Singh, R., Singh, S., Singh, R., & Bandyopadhyay, S. (2005). Experimental studies on immunosuppressive effects of peste des petits ruminants (PPR) virus in goats. Comparative immunology, microbiology and infectious diseases, 28: 287-296.
Roeder, P., Obi, T., Taylor, W., & Diallo, A. (1999). Recognizing peste des petits ruminants: a field manual. FAO Animal Health Manual: 5.
Rowland, A., & Bourdin, P. (1970). The histological relationship between peste des petits runminants and kata in West Africa. Revue d'elevage et de medecine veterinaire des pays tropicaux, 23:301-307.
Rowland, A., Scott, G., & Hill, D. (1969). The pathology of an erosive stomatitis and enteritis in West African dwarf goats. Journal of pathology, 98: 83-87.
Sen, A., Saravanan, P., Balamurugan, V., Bhanuprakash, V., Venkatesan, G., Sarkar, J., . . . Sudhakar, S. (2014). Detection of subclinical peste des petits ruminants virus infection in experimental cattle. VirusDisease, 25: 408-411.
Settypalli, T. B. K., Lamien, E., Spergser, J., Lelenta, M., Wade, A., Gelaye, E., . . . Diallo, A. (2016). One-Step Multiplex RT-qPCR Assay for the Detection of Peste des petits ruminants virus, Capripoxvirus, Pasteurella multocida and Mycoplasma capricolum subspecies (ssp.) capripneumoniae. PloS one, 11 : e0153688.
Shahriari, R., Khodakaram-Tafti, A., & Mohammadi, A. (2019). Molecular characterization of Peste des Petits ruminants virus isolated from four outbreaks occurred in southern Iran. BMC veterinary research, 15: 1-6.
Shaila, M., Shamaki, D., Forsyth, M. A., Diallo, A., Goatley, L., Kitching, R., & Barrett, T. (1996). Geographic distribution and epidemiology of peste des petits ruminants viruses. Virus research, 43: 149-153.
Singh, R., Saravanan, P., Sreenivasa, B., Singh, R., & Bandyopadhyay, S. (2004). Prevalence and distribution of peste des petits ruminants virus infection in small ruminants in India. Rev Sci Tech, 23 : 807-819.
Taylor, W. (1984). The distribution and epidemiology of peste des petits ruminants. Preventive veterinary medicine, 2: 157-166.
Ugochukwu, I. C. I., Ugochukwu, E. I., & Chukwu, C. C. (2018). Haematological parameters and serum biochemical assay of West African dwarf goats infected with peste des petits ruminants virus in Nsukka, Enugu State. Comparative Clinical Pathology, 27: 13-19.
Varshuei, R., Hedayati, Z., Aqa Ebrahimiyan, M., Haqiqi, S., Lotfi, M., Kamal Zadeh, M., & Abd Ol-Lahi, D. (2008). Production of PPR vaccine using attenuated strain in cell culture.
Wang, Z., Bao, J., Wu, X., Liu, Y., Li, L., Liu, C., . . . Zhang, W. (2009). Peste des petits ruminants virus in Tibet, China. Emerging infectious diseases, 15: 299.
Zakian, A., Nouri, M., Faramarzian, K., Sharif, M. T., & Rezaie, A. (2016). Comprehensive Review on Peste Des Petits Ruminants [PPR] Disease in Ruminants and Camels: with Emphasis on Clinical Signs and Histopathological Finding. Journal of Veterinary Science & Medical Diagnosis, 4: 2.
Zhu, Z., Li, P., Yang, F., Cao, W., Zhang, X., Dang, W., ... & Zheng, H. (2019). Peste des petits ruminants virus nucleocapsid protein inhibits beta interferon production by interacting with IRF3 to block its activation. Journal of Virology, 93: e00362-19.