بررسی چندشکلی ناحیه اگزون ژن MHC-DRB3 با استفاده از روش PCR-RFLP در برخی نژادهای اسب کشور

محورهای موضوعی : دانش و پژوهش علوم دامی

محمد توکلی ¹ (گروه علوم دامی، دانشگاه آزاد اسلامی واحد کرج، کرج، ایران)
علیرضا نوشری ² (گروه علوم دامی، دانشگاه آزاد اسلامی واحد کرج، کرج، ایران)
بهزاد همتی ³ (گروه علوم دامی، دانشگاه آزاد اسلامی واحد کرج، کرج، ایران)

تاریخ دریافت : 1400/05/13 تاریخ پذیرش : 1400/05/13 تاریخ انتشار : 1400/05/01

کلید واژه: تنوع ژنتیکی, عرب, اسبچه خزر, تروبرد, الدنبرگ, کمپلکس اصلی سازگاری بافتی,

چکیده مقاله :

ژن‌های کمپلکس اصلی سازگاری بافتی (MHC) به‌واسطه ارتباط با پاسخ‌های ایمنی و مقاومت و یا حساسیت به بیماری‌ها اهمیت ویژه‌ای در پرورش اسب دارند. هدف از این تحقیق شناسایی چندشکلی‌های موجود در ناحیه‌ای ازاگزون این ژن و مطالعه‌ی جمعیتی در این جایگاه می‌باشد. برای این منظور تعداد ١٢٠ رأس اسب به‌طور تصادفی از 4 نژاد تروبرد، الدنبرگ، اسبچه خزر و عرب مطالعه گردید. استخراج DNA ژنومی از نمونه‌های خون انجام و واکنش زنجیره‌ای پلیمراز برای تکثیر قطعه 309 جفت بازی ژن MHC انجام شد. محصول واکنش زنجیره‌ای پلیمراز برای انجام واکنش PCR-RFLP و تعیین ژنوتیپ به‌وسیله آنزیم برشی RsaI تحت هضم قرار گرفت. نتایج این تحقیق نشان‌دهنده وجود سه آلل A، Bو Cو شش نوع ژنوتیپAA ،AB ،AC، BB ، BCوCC به ترتیب با فراوانی‌های آللی 3208/0، 3208/0و 3584/0 و فراوانی‌های ژنوتیپی05/0، 25/0، 2917/0، 1333/0، 125/0 و 15/0 درمجموع نژادهای مورد مطالعه بوده است. بیشترین و کمترین فراوانی آللی در نژادهای تروبرد، الدنبرگ، اسبچه خزر و عرب به ترتیب متعلق به آلل های B، A، A، C و A، B، B، A بوده است. نتایج بررسی برقراری تعادل هاردی واینبرگ در این تحقیق با استفاده از آزمون‌های G2 و X2 نشان‌دهنده برقراری تعادل هاردی واینبرگ در نژادهای الدنبرگ و اسبچه خزر و عدم تعادل در نژادهای تروبرد و عرب بوده است. با استفاده از یافته‌های این تحقیق می‌توان از تنوع ژنتیکی موجود در نژادهای مورد مطالعه به‌عنوان یک منبع قابل‌استفاده در برنامه‌های اصلاح نژادی استفاده نمود.

چکیده انگلیسی:

The major histocompatibility complex (MHC) genes are very important in horse breeding according to relationship with immunity response and resistance or susceptibility to disease. The aim of this research is study of polymorphism possible in exon gene region and population genetics. To do this, 120 horses were selected randomly from Thoroughbred, Oldenburg, Caspian pony and Arab breeds. Genomic DNA was extracted via blood samples and polymerase chain reaction was done for a 309 bp MHC gene region. The PCR products were digested by RsaI restriction endonuclease for genotyping determination. Results show that there were three allele of A, B and C and six types of genotype of AA, AB, AC, BB, BC and CC with 0.3208, 0.3208 and 0.3584 allele frequency and 0.05, 0.25, 0.2917, 0.1333, 0.125 and 0.15 genotype frequency in all studied samples respectively. The most and least allele frequency in Thoroughbred, Oldenburg, Caspian pony and Arab are related to B, A, A, C and A, B, B, A alleles respectively. The Hardy-Weinberg equilibrium study by X2 and G2 tests shows the equilibrium situation in Oldenburg and Caspian pony breeds and non-equilibrium situation in Thoroughbred and Arab breeds. The overall results shows that the genetic diversity in studied samples can be used as a resource for horse breeding programs.