List of Articles ساختار جمعیت میکروبی

• Open Access Article
  • Abstract Page
  • Full-Text
  
  1 - تعیین ساختار جمعیت میکروبی شکمبه در بزهای سانن سازگار یافته به جیرهای با فیبر بالا در شمال شرق ایران
  س.ه. ابراهیمی ر. ولی‌زاده و. حیدریان میری
  بز سوئیسی سانن نژادی است که در گله‌های تجاری سراسر جهان یافت می‌شود. در مقاله حاضر، ساختار جمعیت میکروبی بز سانن که به جیره‌های حاوی علوفه خشبی عادت کرده بودند با استفاده از تکنیک پایروسکوئنسینگ مطالعه شده است. نمونه محتویات شکمبه از تعداد 4 رأس بز با استفاده از لوله شک More

  بز سوئیسی سانن نژادی است که در گله‌های تجاری سراسر جهان یافت می‌شود. در مقاله حاضر، ساختار جمعیت میکروبی بز سانن که به جیره‌های حاوی علوفه خشبی عادت کرده بودند با استفاده از تکنیک پایروسکوئنسینگ مطالعه شده است. نمونه محتویات شکمبه از تعداد 4 رأس بز با استفاده از لوله شکمی پس از چرای صبحگاهی گرفته شد. پس از خشک کردن نمونه‌های فوق با روش فریز درایر و استخراج دی‌ان‌ای، ژن‌های 16S rRNA باکتریایی و آرکه‌ای و 18S rRNA پروتوزوآیی با واکنش زنجیره پلیمراز تکثیر شدند و پس از توالی‌یابی با روش پایروسکوئنسینگ تیتانیوم 454، با نرم افزار کیمه آنالیز شدند. تجزیه داده‌ها نشان داد که در سطح جنس، پریوتلا که در شاخه باکتریودتز قرار دارد با غالبیت نسبی 41/29 درصد کل باکتری‌ها اکثریت جنس باکتریایی شکمبه را تشکیل داده بود. جنس طبقه‌بندی نشده‌ای از گروه باکتریودالز در همین شاخه (باکتریودتز) با سهم 01/11 درصد جمعیت باکتریایی به عنوان باکتری غالب دوم تعیین شد. شاخه غالب دوم باکتریایی در شکمبه بزهای سانن فرمیکوتس بود و 3 جنس طبقه‌بندی نشده رده کلستریدیالز ذیل این شاخه جمعا 42/21 درصد جمعیت باکتریایی را به خود اختصاص داده بودند. غالب‌ترین جنس پروتوزوآیی انتودینیوم بود که 78/46 درصد کل جمعیت پروتوزوآ را به خود اختصاص داده بود. پس از آن، اپیدینیوم و افریسکولکس با سهم 37/12 و 92/11 درصدی از کل جمعیت پروتوزوآ در رتبه دوم و سوم قرار داشتند. توالی‌های مرتبط با متانوپلاسماتالز به عنوان آرکه غالب جمعیت میکروبی در شکمبه بزهای سانن شناسایی شدند. متانوبرویباکتر گوتسچالکی کلید و متانوبرویباکتر رمیننتیوم کلید با فراوانی به ترتیب 79/35 و 36/13 درصد دومین و سومین گروه تولید‌کننده متان بودند. نسبت توالی‌های طبقه‌بندی نشده بالا در نمونه‌های محتویات شکمبه بزهای سانن در شرایط این مطالعه نشان می‌دهد باید مطالعات بیشتری بر اساس روش‌های مبتنی بر کشت در خصوص شناسایی گونه‌های مربوطه که احتمالاً در هضم فیبر نقش مهم و اساسی دارند انجام شود. Manuscript profile