• فهرس المقالات Urease

      • حرية الوصول المقاله

        1 - Potentiometric Study on the Interaction of Hexadecyl Ttimethyl Ammonium Bromide (HTAB) with Urease Enzyme
        Morteza Keshavarz
        In this research, the interaction of hexadecyl trimahyl ammonium bromide (HTAB) with enzyme ureasehas been investigated comprehensively at different experimental conditions such as ionic strength, proteinconcentration using ion selective membrane electrode of surfactant أکثر
        In this research, the interaction of hexadecyl trimahyl ammonium bromide (HTAB) with enzyme ureasehas been investigated comprehensively at different experimental conditions such as ionic strength, proteinconcentration using ion selective membrane electrode of surfactants. The obtained binding isotherms frompotentiometnc studies have been analyzed by different theories such as Wyman binding potennal.Seatehard diagram, binding capacity concept and Hill equation. The results indicate the aggregation ofurease at concentrations more than I mg/m1 of protein. !mu-easing the ionic strength to I m41, causes todecrease the interaction with mase but increasing the ionic strength to more than I inftl again causes toincrease the interaction. Tlus issue can be due to stability of unease at ionic strength oil rn.M. increasingthe concentration of urease to 3 RIM causes to gradual and regular decreasing of interaction and at higherconcentrations, the intense increase in interaction is resulted. Increasing pH from 6.5 to 9.7 does not creategreat changes at binding isotherms that is due to slight change of dissociation &pee of acidic and basicgroups and third structure of urease at this limit. In all studied cases m comparison with similar case, itshows stronger interaction with urease. This issue is Justifiable according to longer hydrocarbon tail thatincreases its hydrophobic properly that indicates the special role of hydrophobic interactions in interactionsprocess of ionic surfatttuns with proteins. تفاصيل المقالة
      • حرية الوصول المقاله

        2 - تاثیر قرق بر فعالیت آنزیم های خاک در رویشگاه ارس (Juniperus excelsa) چهارطاق اردل
        محمد متینی‌زاده مصطفی خوشنویس مریم تیموری انوشیروان شیروانی
        مدیریت حفاظت و قرق رویشگاه های جنگلی می تواند به بهبود ویژگی های کیفی اکوسیستمی مانند توالی پوشش گیاهی، خصوصیات خاک و تجدید حیات کمک کند. آنزیم های خاک شاخص فعالیت زیستی خاک محسوب شده و برای ارزیابی کیفیت و حاصلخیزی خاک به کار می روند. کارهای اندکی درخصوص اثرات مدیریت ب أکثر
        مدیریت حفاظت و قرق رویشگاه های جنگلی می تواند به بهبود ویژگی های کیفی اکوسیستمی مانند توالی پوشش گیاهی، خصوصیات خاک و تجدید حیات کمک کند. آنزیم های خاک شاخص فعالیت زیستی خاک محسوب شده و برای ارزیابی کیفیت و حاصلخیزی خاک به کار می روند. کارهای اندکی درخصوص اثرات مدیریت بر فعالیت زیستی خاک در اکوسیستم های جنگلی انجام شده است. هدف از این پژوهش، بررسی تغییرات فصلی فعالیت آنزیم های آلکالین و اسید فسفاتاز، دهیدروژناز و اوره آز در یک رویشگاه قرق شده در زیر و بیرون تاج پوشش گونه ارس (Juniperus excelsa) و مقایسه آن با همین شرایط در خارج از قرق بود. به همین منظور، نمونه های مورد نیاز خاک در فصل های بهار و پاییز جمع آوری شدند. فراوانی بیشتر آنزیم های خاک در پاییز نشان دادند که تحت تاثیر فصل، تغییر می کنند. فعالیت همه آنزیم های بررسی شده در خاک در زیر تاج پوشش در هر دو رویشگاه بیشتر از بیرون تاج بود که می تواند انعکاس دهنده فعالیت جامعه میکروبی مرتبط باشد. نتایج نشان داد که فعالیت آنزیم های خاک بر اثر قرق افزایش می یابد. این افزایش منجر به عملکرد بهتر فرآیندهای مربوط به تجزیه مواد آلی و چرخه های غذایی می گردد. تفاصيل المقالة
      • حرية الوصول المقاله

        3 - تولید نانوذرات اوره‎آز به روش حلال‌زدایی و مقایسه برخی خواص آن‎ها با اوره‎آز آزاد
        راضیه سادات حسینی سید محمد حسین رضویان محمدعلی قاسم‌زاده
        هدف: آنزیم‌ها به‌عنوان کاتالیزور طبیعی در واکنش‌های بیولوژیکی عمل می‌کنند. اما دارای محدودیت‌هایی مانند عدم پایداری حرارتی، طول عمر کوتاه و عدم پایداری آنها در محیط آلی نیز می‌باشند. بنابراین، دانشمندان سعی کرده‌اند عملکرد آنزیم‌ها را به روش‎‎‎‎‎&lrm أکثر
        هدف: آنزیم‌ها به‌عنوان کاتالیزور طبیعی در واکنش‌های بیولوژیکی عمل می‌کنند. اما دارای محدودیت‌هایی مانند عدم پایداری حرارتی، طول عمر کوتاه و عدم پایداری آنها در محیط آلی نیز می‌باشند. بنابراین، دانشمندان سعی کرده‌اند عملکرد آنزیم‌ها را به روش‎‎‎‎‎‎‎‎های‎‎‎‎‎‎‎‎‎‎ ‌مختلف ازجمله فناوری نانو بهبود ببخشند. لذا، هدف مطالعه حاضر تولید نانوذرات آنزیمی و ارزیابی برخی خواص آن‌ها است، که به دلیل اهمیت اوره‎آز در پزشکی، کشاورزی و صنعت روی آن کار می‌شود.مواد و روش‌ها: در این پژوهش، افزایش پایداری اوره‎آز براساس تولید نانوذرات آنزیمی با روش حلال‎زدایی انجام شد. نانوذرات سنتز شده با استفاده از طیف‌سنجی مادون ‌قرمز تبدیل فوریه (FTIR)، طیف‌سنجی مرئی- فرابنفش (UV-Vis) و میکروسکوپ الکترونی روبشی (SEM) بررسی شد. همچنین فعالیت‌های کلی و اختصاصی آنزیم‌های آزاد و نانو در دمای °C۳۷ اندازه‌گیری و باهم مقایسه شد. به‌علاوه، آنزیم‌های آزاد و نانو به مدت 10 دقیقه در دماهای بین ۳۰ تا °C۷۰ انکوبه و سپس فعالیت آن‌ها اندازه‌گیری شد.یافته‌ها: نتایج حاصل از طیف‌سنجی و میکروسکوپ الکترونی روبشی، تشکیل نانوذرات اوره‎آز را تأیید کرد. همچنین نتایج تعیین فعالیت نشان داد که با تشکیل نانوذرات آنزیمی، علی‌رغم کاهش فعالیت کل آنزیم، فعالیت اختصاصی آن 46/43 درصد افزایش یافت.دمای مطلوب فعالیت کل اوره‎آز آزاد °C50 و نانوذرات اوره‎آز °C60 بود. پس از 10 دقیقه انکوباسیون در °C70، آنزیم‌های آزاد و نانو به ترتیب 2 و 32 درصد فعالیت خود را حفظ کردند که نشان‌دهنده افزایش پایداری حرارتی در این روش است.نتیجه‌گیری: با تهیه نانوذرات آنزیمی می توان فعالیت و کاربرد آنها را در صنعت بهبود بخشید. تفاصيل المقالة
      • حرية الوصول المقاله

        4 - مطالعه اثر گیاه بومادران بر روی هلیکوباکترپیلوری باکمک روش شبیه سازی داکینگ ملکولی
        خدیجه توکلی هفشجانی فاطمه رئیسی سرتیشنیزی الهه صابری
        چکیده مقاومت هلیکوباکترپیلوری نسبت به آنتی بیوتیک‌های رایج علت اصلی پایین بودن درصدریشه‌کنی این باکتری درکشورهای درحال توسعه می‌باشد.به همین دلیل نیاز به یک داروی جایگزین برای درمان عفونت هلیکوباکترپیلوری وجود دارد.داروی جدید باید موثر،کم عارضه ،همراه با اثرات خوب برعلی أکثر
        چکیده مقاومت هلیکوباکترپیلوری نسبت به آنتی بیوتیک‌های رایج علت اصلی پایین بودن درصدریشه‌کنی این باکتری درکشورهای درحال توسعه می‌باشد.به همین دلیل نیاز به یک داروی جایگزین برای درمان عفونت هلیکوباکترپیلوری وجود دارد.داروی جدید باید موثر،کم عارضه ،همراه با اثرات خوب برعلیه هلیکوباکترپیلوری بوده ودرضمن موجب مقاومت باکتری نسبت به دارو نگردد.استفاده از گیاهان دارویی یکی از راه های حل معضل مقاومت میکروبی به شمار می آید.زیرا ترکیبات ثانویه گیاهان مولکول‌های پیچیده ای هستند که تعدادزیادی از آن‌ها دارای فعالیت های بیولوژیک می‌باشند.توجه محققان به ترکیب های موثر گیاهی ،به عنوان راه حلی برای معضل مقاومت هلیکوباکترپیلوری نسبت به آنتی بیوتیک‌های رایج است ویکی ازآن ها گیاه بومادران می‌باشد که ترکیبات آن سبب ازبین بردن هلیکوباکترپیلوری می‌شود همچنین مطالعات تجربی نشان داد که آنزیم اوره‌آز این باکتری سبب حیات آن در معده می‌شود پس این فرض به وجود آمد که ترکیبات گیاه بومادران ممکن است بر روی آنزیم اوره آز تآثیر داشته باشند مبحث طراحی دارویی گیاهی برای مقابله با هلیکوباکترپیلوری می باشد که با استفاده از شبیه سازی داکینگ مولکولی ونرم افزار اتوداک۴ انجام شد آلفاپنین با انرژی آزاد اتصال(5/15-) وکاریوفلین اکسید با انرژی آزاد اتصال(5/43-) وبیسموت با انرژی آزاد اتصال(4/92-) برای مهار آنزیم اوره آز می توانند استفاده شوند. کاریوفلین اکسید با انرژی اتصال بالامهارکننده بهتری برای آنزیم است. کلمات کلیدی: هلیکوباکتر پیلوری، آنزیم اوره آز، داکینگ ملکولی، آلفاپنین، کاریوفلین اکسید  تفاصيل المقالة
      • حرية الوصول المقاله

        5 - Picard Iteration Method to Kinetic Analysis of Thermal Inactivation of Enzyme as Applied in Biotechnology
        A. Olurotimi Adeleye M. Gbeminiyi Sobamowo
        In this work, Picard iteration method is used to obtain analytical expressions for the prediction of molar concentration of native and denatured jack bean urease (EC 3.5.1.5) through the three-reaction steps kinetic model of thermal inactivation of the urease. The obtai أکثر
        In this work, Picard iteration method is used to obtain analytical expressions for the prediction of molar concentration of native and denatured jack bean urease (EC 3.5.1.5) through the three-reaction steps kinetic model of thermal inactivation of the urease. The obtained solutions are used to study the kinetics of thermal inactivation of the enzyme as applied in biotechnology. The analytical solutions are verified with numerical solutions using Runge –Kutta with shooting method and good agreements are established between the solutions. From the parametric studies using the iterative method, the molar concentration of native enzyme decreases as the time increases while the molar concentration of the denatured enzyme increases as the time increases. The time taken to reach the maximum value of the molar concentration of native enzyme is the same as the time taken to reach the minimum value of the molar concentration of the denature enzyme. The information given in this theoretical investigation will assist in the kinetic analysis of the experimental results over handling rate constants and molar concentrations. تفاصيل المقالة
      • حرية الوصول المقاله

        6 - Utilization of Urea and Urease Treated Rice Straw by Indigenous Growing Cattle
        آ. اکتر م. اسدوزمان م.م. حسین ال. اسد
        The experiment was conducted to study the effect of treatment of rice straw with urea and a urease containing midden soil on the chemical composition of treated rice straw, feed intake of the animals, nutrients digestibility, body weight gain, feed conversion efficiency أکثر
        The experiment was conducted to study the effect of treatment of rice straw with urea and a urease containing midden soil on the chemical composition of treated rice straw, feed intake of the animals, nutrients digestibility, body weight gain, feed conversion efficiency and overall economy of feeding for a period of 105 days. Twelve indigenous growing cattle (live weight 130.00±1.67 kg) were selected and divided into four groups having three animals in each group. The animals received 3.0% urea + 2.0% midden soil treated rice straw (group A), 3.0% urea + 3.0% midden soil treated rice straw (group B), 3.0% urea + 4.0% midden soil treated rice straw (group C) and 3.0% urea + 5.0% midden soil treated rice straw (group D). In addition, all the animals were supplied with 2 kg green grass, 450 g concentrate mixture and 40 g salt per 100 kg body weight. Treatment of rice straw with 3.0% urea+ 2.0% midden soil lead to an increase in crude protein content from 3.30 to 7.08%, which was further increased by 7.40, 7.90 and 8.14% if treated with 3.0% urea + 3.0% midden soil, 3.0% urea + 4.0% midden soil and 3.0% urea + 5.0% midden soil, respectively. The total live weight gain by the end of the experimental period (105 days) was 39.00, 42.50, 46.50 and 49.00 kg for groups A, B, C and D respectively. The addition of 5.0% midden soil as a urease source with 3.0% urea (D) treated rice straw not only significantly (P<0.01) increased the coefficient of digestibility of dry matter (DM), crude protein (CP), crude fibre (CF), ether extracts (EE) and nitrogen free extract (NFE), but also significantly (P<0.05) increased the coefficient of digestibility of (OM) compared to treatment of rice straw with 3.0% urea + 4.0% midden soil (C), 3.0% urea + 3.0% midden soil (B) or 3.0% urea + 2.0% midden soil (A). Digestible organic matter (DOM), digestible crude protein (DCP), digestible crude fibre (DCF), digestible nitrogen free extract (DNFE) and total digestible nutrients (TDN) contents were significantly (P<0.01) higher in diet D, compared to diets A, B and C. Total profit of meat production in group D was significantly higher (P<0.01) than in groups A, B and C. تفاصيل المقالة
      • حرية الوصول المقاله

        7 - ارزیابی نقش آزمون اوره آز سریع در مقایسه با PCR به منظور تشخیص عفونت هلیکوباکتر پیلوری
        محمد کارگر سید هادی رضوی زادگان کاووس اشراقیان محمد یعقوب راجپوت صادق قربانی دالینی مهدی کارگر
        سابقه و هدف: هلیکوباکتر پیلوری یک ارگانیسم گرم منفی، مارپیچی شکل و غیر مهاجم است. این باکتری عامل زخم معده است و نقش مهمی در ایجاد سرطان ولنفوم معده دارد. هدف از این پژوهش ارزیابی حساسیت و ویژگی آزمایش اوره‌آز سریع در مقایسه باPCR است. مواد و روش ها: تعداد30 بیمار أکثر
        سابقه و هدف: هلیکوباکتر پیلوری یک ارگانیسم گرم منفی، مارپیچی شکل و غیر مهاجم است. این باکتری عامل زخم معده است و نقش مهمی در ایجاد سرطان ولنفوم معده دارد. هدف از این پژوهش ارزیابی حساسیت و ویژگی آزمایش اوره‌آز سریع در مقایسه باPCR است. مواد و روش ها: تعداد30 بیماردارای زخم پپتیک (تست) و30 بیمار دارای سوء هاضمه (شاهد) در سال های 1385و 1386 از دو مرکز اندوسکوپی استان فارس انتخاب شدند. از هر بیمار یک نمونه ی بیوپسی معده تهیه و وجود عفونت هلیکوباکتر پیلوری با آزمون های اوره آز سریع و PCR به عنوان استاندارد طلایی بررسی گردید. یافته ها: میزان آلودگی، حساسیت، ویژگی ،ارزش پیش بینی مثبت (PPV) و ارزش پیش بینی منفی (NPV) با استفاده از اوره آز سریع به ترتیب در گروه تست 67/76% ،76/80% ،23/69% ، 92/85% و 65/60% و در گروه شاهد 67/46% ، 94/52% ، 18/68% ،62/41% ، 17/77%تشخیص داده شد. نتیجه گیری: این تحقیق نشان داد که ارزیابی آلودگی ، حساسیت و ویژگی آزمون اوره آز سریع برای تشخیص هلیکوباکتر پیلوری در بیمارانی که تحت درمان قرار نگرفته اند قابل قبول می باشد. اما استفاده از این آزمون در بیماران تحت درمان با آنتی بیوتیک ها و به ویژه داروهای مهار کننده ی پمپ پروتونی در زمان استاندارد (2 ساعت) ، حساسیت و ویژگی قابل قبولی را برای تشخیص باکتری ندارد. به همین دلیل انجام آزمون های تکمیلی دراین بیماران پیشنهاد می گردد. تفاصيل المقالة
      • حرية الوصول المقاله

        8 - پایش باکتری های تولید کننده سیمان زیستی و تثبیت کننده خاک در زیستگاه های کویری ایران
        مهدی کارگر محمد کارگر
        سابقه و هدف: یکی از روش های پیشنهاد شده به منظور تثبیت و استحکام خاک رسوب کلسیت به واسطه تحریک میکروبی (MICP) است. این مطالعه با هدف جداسازی باکتری های تجزیه کننده اوره موثر در ایجاد سیمان زیستی از خاک های خشک و کویری انجام شد.مواد و روش ها: این پژوهش به صورت مقطعی-توصی أکثر
        سابقه و هدف: یکی از روش های پیشنهاد شده به منظور تثبیت و استحکام خاک رسوب کلسیت به واسطه تحریک میکروبی (MICP) است. این مطالعه با هدف جداسازی باکتری های تجزیه کننده اوره موثر در ایجاد سیمان زیستی از خاک های خشک و کویری انجام شد.مواد و روش ها: این پژوهش به صورت مقطعی-توصیفی بر روی 280 نمونه جمع آوری شده ازخاک های مناطق مختلف ایران انجام شد. کشت نمونه ها بر روی محیط اوره براث انجام شد. سپس سنجش فعالیت آنزیم اوره آز باکتری های تجزیه کننده اوره انجام شد. باکتری های فعال توسط آزمون های متداول بیوشیمیایی و روش16S rRNA تعیین هویت شدند. تولید سیمان زیستی در باکتری های اوره از مثبت جداسازی شده در pH و دما های مختلف مورد ارزیابی قرار گرفت و با سویه استاندار اسپوروسارسینا پاسترویی ATCC 11589 مقایسه گردید. در نهایت کریستال های کربنات کلسیم در شرایط بهینه دمای 25 درجه سلیسیوس و 8.5 pH با آزمون بلورشناسی پرتو ایکس (XRD) مورد بررسی قرار گرفتند.یافته ها: 304 جدایه از 5 جنس مختلف جداسازی گردید. جنس های باسیلوس و اسپوراسارسینا از مهم ترین باکتری های تجزیه کننده اوره جداسازی از مناطق خشک و کویری بودند. بیشترین میزان کربنات کلسیم در دمای 25 درجه سلیسیوس و 8.5 pH تولید شد. 10 جدایه برتر موثر در تولید آنزیم اوره آز و سیمان زیستی با استفاده از روش مولکولی تعیین هویت و در بانک ژنی ثبت گردیدند. همچنین تولید سیمان زیستی سویه های برتر با استفاده از آزمون XRD تایید گردید.نتیجه گیری: نتایج نشان که در تولید کریستال های کربنات کلسیم مقدار اوره و کلرید کلسیم نقش اساسی دارند. همچنین باکتری اسپوروسارسینا پاستورویی از مهم ترین باکتری های تولید کننده سیمان زیستی بود. از این رو بهینه سازی شرایط رشد در حد بالاتر به منظور استفاده کاربردی از این باکتری در تثبیت شن های روان، استحکام زمین و پل سازی پیشنهاد می گردد. تفاصيل المقالة
      • حرية الوصول المقاله

        9 - اثر ضدمیکروبی نانوذرات بر باکتری‌های اوره‌آز مثبت غیر از هلیکوباکتر پیلوری جدا شده از بیماران مبتلا به زخم معده
        جمیله نوروزی مهتاب گل محمدی قادیکلایی فرزانه حسینی شهرام آگاه سیامک خالقی
        سابقه و هدف: اخیراً گزارش‌هایی مبنی بر وجود باکتری‌های اوره‌آز مثبت غیر از هلیکوباکتر پیلوری در معده بیماران مبتلا به زخم معده یافت شده است. هدف از این پژوهش، جداسازی و شناسایی باکتری‌های اوره‌آز مثبت غیر از هلیکوباکتر پیلوری در بیماران مبتلا به أکثر
        سابقه و هدف: اخیراً گزارش‌هایی مبنی بر وجود باکتری‌های اوره‌آز مثبت غیر از هلیکوباکتر پیلوری در معده بیماران مبتلا به زخم معده یافت شده است. هدف از این پژوهش، جداسازی و شناسایی باکتری‌های اوره‌آز مثبت غیر از هلیکوباکتر پیلوری در بیماران مبتلا به زخم معده و بررسی اثر ضدمیکروبی نانوذرات نقره بر روی آن‌ها بود. مواد و روش‌ها: 50 نمونه از بیوپسی آنتروم معده بیماران مبتلا به زخم معده مراجعه کننده به بیمارستان مجتمع رسول اکرم (ص) تهران توسط پزشکان متخصص گوارشی جمع آوری شد. نمونه‌ها در محیط کشت مایع انتقالی به آزمایشگاه میکروب شناسی منتقل شدند. باکتری‌های اوره‌آز مثبت موجود در معده با روش‌های استاندارد باکتریولوژی مانند کشت در محیط‌های اختصاصی و انجام تست‌های بیوشیمیایی شناسایی گردیدند. سپس اثر ضدمیکروبی نانوذرات نقره بر روی باکتری‌های اوره‌آز مثبت، با تعیین حداقل غلظت مهار کنندگی (MIC) و حداقل غلظت کشندگی (MBC) مشخص گردید. یافته‌ها: نتایج نشان داد که در 42% از نمونه‌های جمع آوری شده باکتری‌های اوره‌آز مثبت (10% کلبسیلانمونیه، 10% استافیلوکوکوس اورئوس، 8% انتروباکتر کلواکه، 6% انتروباکتر آگلومرانس، 4% کلبسیلا اوزنه و 4% سیتروباکتر دایورسوس) وجود داشتند. همچنین MIC ضدمیکروبی نانوذرات نقره بر روی جدایه های باکتریایی بین 56/1 تا 5/12 و MBC آن‌ها بین 125/3 تا 25 تعیین گردید. نتیجه گیری: رشد برخی از باکتری‌های اوره‌آز مثبت می‌تواند منجر به مشاهده مثبت کاذب در تست‌های تنفسی اوره و اوره‌آز سریع گردد. بنابراین توصیه می‌شود که برای تشخیص عامل زخم معده، تمام باکتری‌های اوره‌آز مثبت موجود در معده مورد شناسایی قرار گرفته و درمان بر اساس آن‌ها صورت گیرد. از طرفی به دلیل بروز مقاومت باکتری‌ها نسبت به اکثر داروهای رایج، امکان استفاده از اثرات ضدمیکروبی نانوذرات نقره برعلیه باکتری‌های مورد پژوهش وجود دارد. تفاصيل المقالة