• فهرس المقالات 16srRNA

      • حرية الوصول المقاله

        1 - بررسی فیلوژنی 16 گونه ازدوکفه ای ها در سواحل خلیج فارسجزایر هنگام، لارک، قشم و لنگه )با استفاده از ژن 16srRNA
        شهره مسائلی پرگل قوام مصطفوی همایون حسین زاده صحافی سعید تمدنی عبدالرضا نبی نژاد وحید نعمان
        زمینه و هدف:رده دوکفه ای ها ازبزرگ ترین رده های شاخه نرم­تنان می­باشد. بسیاری از گونه های نرم تنان خلیج فارس شاخص و از نظر تجاری حائز اهمیت اند و برخی از نظر تنوع زیستی، چرخه غذایی و مطالعات تکاملی اهمیت دارند. مطالعات بسیاری برای شناسایی و رده بندی دوکفه ای های ایران ص أکثر
        زمینه و هدف:رده دوکفه ای ها ازبزرگ ترین رده های شاخه نرم­تنان می­باشد. بسیاری از گونه های نرم تنان خلیج فارس شاخص و از نظر تجاری حائز اهمیت اند و برخی از نظر تنوع زیستی، چرخه غذایی و مطالعات تکاملی اهمیت دارند. مطالعات بسیاری برای شناسایی و رده بندی دوکفه ای های ایران صورت گرفته است که منجر به شناسایی آن ها شده است. هدف از مطالعه حاضر بررسی فیلوژنتیکی و مورفولوژیک دوکفه ای ها در خلیج فارس می باشد.روش کار:نمونه برداری در سواحل بندر عباس، قشم، لارک، هنگام و لنگه در خلیج­ فارس انجام گردید و پس از بررسی ویژگی­ های مورفولوژیک ، سپس استخراج DNAبا روش فنل کلروفرم ایزوآمیل الکل و روش تکثیر s rRNA16 و سپس توالی­ یابی انجام شد. در این مطالعه توالی­ ها برای اولین بار ازخلیج ­فارس گزارش شده است. داده ها با نرم افزارهای فیلوژنی تحلیل شد.یافته ها:مقایسه توالی ژن 16sاین گونه ها با گونه های مطالعه شده از سایر مناطق کره زمین که اطلاعات مولکولی آن ها در دسترس بود، نشان داد که برخی از گونه های دوکفه ای در ایران تشابه ژنتیکی قابل توجه ای با سایر گونه های مطالعه شده ندارند و در ایران ایزوله شده اند و تعدادی تشابه ژنتیکی بالایی با گونه های مطالعه شده دارند و در یک کلاد با بوت استرپ بالا با گونه های سایر دنیا قرار می گیرندنتیجه گیری:نتایج نشان داد رده بندی صورت گرفته بر اساس تعیین توالی ژن 16sکاملاًمطابق با رده بندی های انجام شده بر اساس صفات ریختی است و این دو تایید کننده هم دیگر هستند. تفاصيل المقالة
      • حرية الوصول المقاله

        2 - جداسازی و شناسایی مولکولی لیزنی باسیلوس ماکروئیدس از ریشه گندم و بررسی فعالیت ضد قارچی آن علیه گونه های تریکودرمایی
        محبوبه چوپان وامرزانی حمیدرضا پردلی مجید مقبلی
        سابقه و هدف: باکتری لیزنی باسیلوس باکتری اندوفتیک است که از گیاه در برابر شرایط فیزیولوژیکی و زیست محیطی حفاظت می نماید. این مطالعه با هدف جداسازی و شناسایی مولکولی باکتری اندوفیت لیزنی باسیلوس ماکروئیدس از ریشه گندم و بررسی فعالیت ضد قارچی آن علیه گونه های تریکودرمایی أکثر
        سابقه و هدف: باکتری لیزنی باسیلوس باکتری اندوفتیک است که از گیاه در برابر شرایط فیزیولوژیکی و زیست محیطی حفاظت می نماید. این مطالعه با هدف جداسازی و شناسایی مولکولی باکتری اندوفیت لیزنی باسیلوس ماکروئیدس از ریشه گندم و بررسی فعالیت ضد قارچی آن علیه گونه های تریکودرمایی انجام شد. مواد و روش ها: به منظور جداسازی باکتری های اندوفتیک از عصاره ریشه و ساقه گندم های کشت شده در مناطق مختلف استان مازندران و گلستان استفاده گردید. فعالیت ضد قارچی آن ها با روش کشت متقابل بر روی محیط سیب زمینی دکستروز آگار(PDA) مورد ارزیابی قرار گرفت. پس از استخراج DNA ژنومی، از روش PCR به منظور تکثیر ژن16S rRNA استفاده گردید. به منظور شناسایی دقیق باکتری جداسازی شده، محصول PCR تعیین توالی و ترادف بازی آن BLAST گردید. یافته ها: باکتری جداسازی شده قادر به مهار رشد قارچ های بیوکنترلی بود. نتایج تعیین توالی نشان داد که باکتری جداسازی شده متعلق به جنس لیزنی باسیلوس است و شباهت 99 درصدی به گونه لیزنی باسیلوس ماکروئیدس W1 دارد. نتیجه گیری: این مطالعه اولین گزارش جداسازی لیزنی باسیلوس از گیاه تحت عنوان اندوفتیک است. باکتری اندوفیت جداسازی شده در این بررسی می تواند به منظور استخراج، شناسایی و به کارگیری متابولیت های مهاری آن در طراحی و تولید داروهای ضد قارچی مورد استفاده قرار گیرد. تفاصيل المقالة
      • حرية الوصول المقاله

        3 - تاثیر عصاره های آبی و اتانولی جلبک قهوه ای Sargassum muticum برفلور میکروبی روده در موش‌های صحرایی نر چاق
        وحیده زرین طاهره طلایی محمدرضا طاهری زاده نادر تنیده
        سابقه و هدف: بر اساس مطالعات جدید، میکروبیوتای روده نقش کلیدی در عملکرد کلی میزبان از جمله متابولیسم آن دارد و یکی از عوامل اصلی ایجاد کننده چاقی میباشد. همچنین، جلبکهای دریایی به علت داشتن فیبر بالا میتوانند با تحریک رشد باکتریهای مفید و مهار رشد گونههای مضر، فلور أکثر
        سابقه و هدف: بر اساس مطالعات جدید، میکروبیوتای روده نقش کلیدی در عملکرد کلی میزبان از جمله متابولیسم آن دارد و یکی از عوامل اصلی ایجاد کننده چاقی میباشد. همچنین، جلبکهای دریایی به علت داشتن فیبر بالا میتوانند با تحریک رشد باکتریهای مفید و مهار رشد گونههای مضر، فلور میکروبی روده را تنظیم کنند. هدف از این مطالعه، بررسی اثرجلبک دریایی Sargassum muticum بر فلور میکروبی روده در موشهای صحرایی چاق بود.مواد و روشها: در این مطالعه عصارههای اتانولی و آبی جلبک به مدت 8 هفته به موشهای چاق داده شد و سپس میکروارگانیسم‌های روده از طریق توالی یابی16S rRNA در همه گروهها تجزیه و تحلیل گردید.یافتهها: نسبت توزیع میکروارگانیسمهای رودهای نشان داد کهBacteroides وFirmicutes بهعنوان شاخههای غالب در روده موش‌ها بودند. تجزیه و تحلیل میکروارگانیسمها نشان داد که باکتریهای مرتبط با چاقی کاهش یافته و جنسهای مرتبط با لاغری در گروههایی که عصاره جلبکی دریافت کردند در مقایسه با گروه کنترل افزایش یافت.Clostridium جنس غالب با پتانسیل بیماری‌زایی وLactobacillus جنس غالب در گروه لاکتیک اسید بودند. علاوهبراین، تغذیه موش‌های چاق با عصارههای جلبک‌ دریایی باعث کاهش وزن و کاهش میل به غذا در مقایسه با گروه کنترل چاق گردید.نتیجهگیری: نتایح ما نشان داد مصرف جلبک‌ دریایی قهوه‌ای Sargassum muticum در رژیم غذایی روزانه می‌تواند میکروبیوتای روده را متعادل کند و همچنین به دلیل داشتن فیبر بالا سبب کاهش وزن گردد. تفاصيل المقالة
      • حرية الوصول المقاله

        4 - جداسازی و شناسایی مولکولی رودوباکتر اسفروئیدیس از استخر بی هوازی سیستم تصفیه فاضلاب
        مجید مقبلی محمدرضا شفاعتی
        سابقه و هدف: رودوباکتر باکتری گرم منفی، میله‌ای شکل و فتوتروفیک ارغوانی است که با اکسیداسیون سولفید هیدرژن به گوگرد قادر به حذف این ترکیب از محیط می‌باشد. هدف از این پژوهش، جداسازی و شناسایی مولکولی رودوباکتر بود. مواد و روش‌ها: به منظور جداسازی رودوباکت أکثر
        سابقه و هدف: رودوباکتر باکتری گرم منفی، میله‌ای شکل و فتوتروفیک ارغوانی است که با اکسیداسیون سولفید هیدرژن به گوگرد قادر به حذف این ترکیب از محیط می‌باشد. هدف از این پژوهش، جداسازی و شناسایی مولکولی رودوباکتر بود. مواد و روش‌ها: به منظور جداسازی رودوباکتر، نمونه‌های پساب از استخر بی‌هوازی تصفیه خانه فاضلاب مهدی شهر جمع آوری و بر روی محیط فیننیگ I کشت داده شدند. پس از استخراج DNA ژنومی از باکتری‌های رشد کرده بر روی محیط یاد شده، از روش PCR به منظور تکثیر ژن 16S rRNA استفاده گردید. سپس محصول PCR تعیین توالی و به منظور شناسایی دقیق باکتری جداسازی شده، ترادف بازی آن BLAST گردید. نتایج: باکتری جداسازی شده از نظر ماکروسکوپی، بر روی محیط کشت اختصاصی کلنی قرمز ایجاد کرد و از نظر میکروسکوپی، میله‌ای گرم منفی بود. نتایج به دست آمده از مقایسه ترادف بازی 16S rRNA باکتری جداسازی شده نشان داد که این باکتری متعلق به جنس رودوباکتر است و شباهت 99% به گونه رودوباکتر اسفروئیدس دارد.. نتیجه گیری: این مطالعه اولین گزارش جداسازی رودوباکتر در ایران می‌باشد. همچنین در این بررسی برای اولین بار یک سویه جدید از گونه رودوباکتر اسفیروئیدس از فاضلاب جداسازی و به عنوان سویه IRSMM1 در بانک جهانی ژن با شماره JX262384 ثبت گردید. تفاصيل المقالة
      • حرية الوصول المقاله

        5 - ارزیابی شیوع هلیکوباکتر هپاتیکوس با روش PCR در موش‌های خانگی (Mus musculus)استان اصفهان
        عباس دوستی علی ظهور مریم باقرنژاد صادق قربانی دالینی
        سابقه و هدف: هلیکوباکتر هپاتیکوس یکی از شایع‌ترین گونه‌های هلیکوباکتر می‌باشد. این باکتری یکی از عوامل مهم ایجاد بیماری‌های گوناگون گوارشی، صفراوی و کبدی می‌باشد. موش متداول‌ترین میزبان این باکتری است و نقش مهمی در انتقال بیماری‌های مش أکثر
        سابقه و هدف: هلیکوباکتر هپاتیکوس یکی از شایع‌ترین گونه‌های هلیکوباکتر می‌باشد. این باکتری یکی از عوامل مهم ایجاد بیماری‌های گوناگون گوارشی، صفراوی و کبدی می‌باشد. موش متداول‌ترین میزبان این باکتری است و نقش مهمی در انتقال بیماری‌های مشترک انسان و حیوان دارد. هدف از این پژوهش تعیین میزان شیوع هلیکوباکتر هپاتیکوس در موش‌های خانگی سطح استان اصفهان با روش PCR می‌باشد. مواد و روش ها: این پژوهش یک بررسی مقطعی- توصیفی است که در تابستان 1388 بر روی 261 موش جمع‌آوری شده از سطح استان اصفهان انجام گردید. پس از تشریح موش‌ها در شرایط استریل، نمونه‌ها (بافت کبد) جداسازی گردید. سپس از پرایمر‌های عمومی به منظور شناسایی جنس هلیکوباکتر و از پرایمر‌های اختصاصی برای شناسایی هلیکوباکتر هپاتیکوس استفاده گردید. یافته‌ها: جنس هلیکوباکتر در 72% از کل نمونه‌ها شناسایی گردید. از این میزان 42% متعلق به گونه هپاتیکوس بود. با آزمون آماری نسبت‌ها مشخص شد که ارتباط معنی‌داری بین جنس هلیکوباکتر و گونه هپاتیکوس در تمام مناطق مورد بررسی وجود دارد. نتیجه گیری: با توجه به اینکه منطقه مورد بررسی، یکی از مناطق پرخطر از نظر ابتلا به گونه‌های مختلف هلیکوباکتر محسوب می‌شود، انجام پایش گسترده و حذف موش‌های خانگی به منظور کاهش خطر ابتلا به بیماری‌های مختلف ضروری به نظر می‌رسد. تفاصيل المقالة