یک روش طبقه‌بندی ترکیبی برای تشخیص سرطان پستان با استفاده از الگوریتم ژنتیک و تنظیم چند مرحله‌ای وزن‌ها در شبکه عصبی MLP
الموضوعات :
امین رضایی پناه
1
(
گروه مهندسی کامپیوتر، موسسه آموزش عالی رهجویان دانش برازجان، بوشهر، ایران
)
سیدجواد میرعابدینی
2
(
گروه مهندسی کامپیوتر-نرم افزار، واحد تهران مرکز، دانشگاه آزاد اسلامی، تهران، ایران
)
علی مبارکی
3
(
گروه مهندسی کامپیوتر-نرم افزار، واحد بوشهر، دانشگاه آزاد اسلامی، بوشهر، ایران
)
الکلمات المفتاحية: Genetic Algorithm, الگوریتم ژنتیک, شبکه عصبی MLP, MLP Neural network, ویژگی‌های موثر, فراطبقه‌بند, پایگاه داده ویسکانسین, Effective Features, Meta Classifier, Wisconsin Database,
ملخص المقالة :
امروزه با گسترش روز افزون علم، استفاده از سیستم های پشتیبان تصمیم می تواند کمک زیادی در سیاست های درمانی پزشک داشته باشد. بدین منظور استفاده از سیستم های هوشمند مصنوعی در پیش بینی و تشخیص سرطان پستان که یکی از رایج ترین سرطان ها در بین زنان می باشد، مورد توجه است. در این مقاله فرآیند تشخیص بیماری سرطان پستان با استفاده از تنظیم چند مرحله ای وزن ها در شبکه عصبی MLP در دو لایه انجام می شود. در لایه اول، سه طبقه بند وجود دارد که به طور همزمان روی داده های مجموعه یادگیری آموزش می بینند. پس از اتمام آموزش خروجی طبقه بندهای لایه اول جمع آوری شده و به همراه داده های مجموعه یادگیری در مجموعه ای جدید قرار می گیرند. این مجموعه به عنوان ورودی به فراطبقه بند لایه دوم داده می شود و فراطبقه بند نگاشت میان خروجی های هر یک از طبقه بندهای معمولی لایه اول را با کلاس های خروجی واقعی مدل می کند. ساختار سه طبقه بند لایه اول و همچنین فراطبقه بند لایه دوم یک شبکه عصبی MLP است که وزن ها، ویژگی های موثر و اندازه لایه مخفی در آن به طور همزمان با استفاده از یک الگوریتم ژنتیک ابتکاری بهینه سازی می شود. به منظور ارزیابی دقت مدل پیشنهادی از پایگاه داده ویسکانسین استفاده می شود که با تست FNA ایجاد شده است. نتایج آزمایش ها روی مجموعه داده WBCD دقت 98.72% را برای روش پیشنهادی نشان می دهد که نسبت به الگوریتم های GAANN، CAFS عملکرد بهتری ارائه داده است.
[1] A. Antoniou, P. D. P. Pharoah, S. Narod, H. A. Risch, J. E. Eyfjord, J. L. Hopper and B. Pasini, “Average risks of breast and ovarian cancer associated with BRCA1 or BRCA2 mutations detected in case series unselected for family history: a combined analysis of 22 studies”, The American Journal of Human Genetics, vol.72, no.5, pp.1117-1130, 2003.
[2] L. C. Hartmann, D. J. Schaid, J. E. Woods, T. P. Crotty, J. L. Myers, P. G. Arnold and, M. H. Frost, “Efficacy of bilateral prophylactic mastectomy in women with a family history of breast cancer”, New England Journal of Medicine, vol.340no. 2, pp.77-84, 1999.
[3], M. C. King, , J. H. Marks and J. B. Mandell, “Breast and ovarian cancer risks due to inherited mutations in BRCA1 and BRCA2”, Science, vol.302, no.5645, pp.643-646, 2003.
[4] C. DeSantis., J. Ma, L. Bryan and, A. Jemal, “Breast cancer statistics, 2013”, CA: a cancer journal for clinicians, vol.64, no.1, pp.52-62, 2014.
[5] K. M. Kash, J. C. Holland, M. S. Halper and, D. G. Miller, “Psychological distress and surveillance behaviors of women with a family history of breast cancer”. JNCI: Journal of the National Cancer Institute, vol.84, no.1, pp.24-30, 1992.
[6], R. L. Siegel, , K. D. Miller and, A. Jemal, “Cancer statistics, 2015”, CA: a cancer journal for clinicians, vol.65, no.1, pp.5-29, 2015.
[7] E. C. Fear, X. Li, S. C. Hagness and, M. A. Stuchly, “Confocal microwave imaging for breast cancer detection: Localization of tumors in three dimensions”, IEEE Transactions on Biomedical Engineering, vol.49, no.8, pp.812-822, 2002.
[8] A. Asuncion and Newman, DUCI machine learning repository, (2007).
[9] مرزوقی, فاطمه و علی اصغر صفائی (۱۳۹۵)، مدلی برای تشخیص سرطان سینه مبتنی بر شبکه های عصبی، کنفرانس بین المللی مهندسی کامپیوتر و فناوری اطلاعات، تهران، دبیرخانه دایمی کنفرانس.
[10] شیخ پور, راضیه و مهدی آقاصرام (1394)، انتخاب ویژگی‌های موثر در تشخیص سرطان سینه با استفاده از مدل‌های پارامتریک یادگیری ماشین. فصلنامه علمی-پژوهشی بیماری های سینه, 8(2), 16-23.
[11] بهمن یار, حسن و بهزاد یثربی (۱۳۹۶)، انتخاب ویژگی های موثر برای تشخیص سرطان سینه با استفاده از الگوریتم شبکه عصبی مصنوعی با رویکرد تکاملی، کنفرانس ملی پژوهش های نوین در برق، کامپیوتر و مهندسی پزشکی، کازرون، دانشگاه آزاد اسلامی واحد کازرون.
[12] سندی, فاطمه؛ الهام عسکری؛ نرجس مطهری و پرستو شهابی چروده (۱۳۹۵)، مقایسه و ارزیابی تکنیک های داده کاوی در جهت تشخیص بهتر سرطان سینه، دومین کنفرانس بین المللی مدیریت و فناوری اطلاعات و ارتباطات، تهران، شرکت خدمات برتر.
[13] M. Nilashi, O. Ibrahim, H. Ahmadi and , L Shahmoradi, “A knowledge-based system for breast cancer classification using fuzzy logic method”, Telematics and Informatics, 34(4), pp.133-144, 2017.
[14], R. D. H. Devi, and, M. I. Devi, “Outlier detection algorithm combined with decision tree classifier for early diagnosis of breast cancer”. Int J Adv Engg Tech, vol. 6,no.2 , pp. 93-98, 2016.
[15] K. J. Wang, B. Makond, K. H. Chen, and, K. M. Wang, “A hybrid classifier combining SMOTE with PSO to estimate 5-year survivability of breast cancer patients”. Applied Soft Computing, 2016, pp.15-24.
[16] J. Diz, G. Marreiros, and A. Freitas, “Applying Data Mining Techniques to Improve Breast Cancer Diagnosis”. Journal of medical systems, vol.40, no.9, pp. 203-210, 2016.
[17] K. Vaidehi, and, T. S. Subashini, “Breast tissue characterization using combined K-NN classifier”, Indian Journal of Science and Technology, vol.8,no.1, pp. 23-26, 2015.
[18] A. Onan, “A fuzzy-rough nearest neighbor classifier combined with consistency-based subset evaluation and instance selection for automated diagnosis of breast cancer”, Expert Systems with Applications, vol.42, no.20, pp.6844-6852, 2015.
[19] R. Sheikhpour, M. A. Sarram, and, R. Sheikhpour , “Particle swarm optimization for bandwidth determination and feature selection of kernel density estimation based classifiers in diagnosis of breast cancer”, Applied Soft Computing, vol.40, pp.113-131, 2016.
[20] F. Ahmad, N. A. M. Isa, Z. Hussain, M. K. Osman, and S. N. Sulaiman, “A GA-based feature selection and parameter optimization of an ANN in diagnosing breast cancer”. Pattern Analysis and Application, vol.18, no.4, pp.861-870, 2015.
[21] MM. Kabir, MM. Islam and K. Murase, “A new wrapper feature selection approach using neural network”, Neurocomputing,vol. 73, pp. 3273–3283, 2010.
[22] G. L. Scott, and H. C. Longuet-Higgins, “Feature grouping by'relocalisation'of eigenvectors of the proximity matrix”. in BMVC,1990, pp. 1-6.
[23] Z. Kim and R. Nevatia, “Uncertain reasoning and learning for feature grouping”, Computer Vision and Image Understanding, vol.76, no.3, pp.278-288, 1999.
[24] G. Gan, and M. K. P. Ng, “Subspace clustering with automatic feature grouping” Pattern Recognition, vol.48, no.11, pp. 3703-3713, 2015.
[25] Breast Cancer Wisconsin (Original) dataset, UCI machine language repository, 1992.
[26] A. Marcano-Cedeño, J. Quintanilla-Domínguez and D. Andina, “WBCD breast cancer database classification applying artificial metaplasticity neural network”, Expert Systems with Applications, vol.38, no.8, pp. 9573-9579, 2011.
[27] MF. Akay, “Support vector machines combined with feature selection for breast cancer diagnosis”, Expert Syst Appl, vol.36, no.2, pp. 3240–3247, 2009.
[28] Y. Peng, Z. Wu, J. Jiang, “A novel feature selection approach for biomedical data classification”, J Biomed Inform, vol.43, no.1, pp.15–23, 2010.
[29] A. Marcano-Ceden˜o, J. Quintanilla-Domı´nguez and D. Andina, “WBCD breast cancer database classification applying artificial metaplasticity neural network”, Expert Syst Appl, vol.38, no.8, pp.9573–9579, 2011.
[30] M. Karabatak, MC. Ince, “An expert system for detection of breast cancer based on association rules and neural network”, Expert Syst Appl, vol.36, no.2, pp. 3465–3469, 2009.
[31] R. Stoean, C. Stoean, “Modeling medical decision making by support vector machines, explaining by rules of evolutionary algorithms with feature selection” Expert Syst Appl, vol.40, no.7, pp.2677–2686, 2013.
[32], V. Chaurasia, and, S. Pal, (2017). “A novel approach for breast cancer detection using data mining techniques”, International Journal of Innovative Research in Computer and Communication Engineering, vol.2, no.1, 2017.
[33] D. H. Wolpert, “Stacked generalization”, Neural networks, vol.5, no.2, 241-259, 1992.
[34] A. Al-Ani, A. Alsukker, and R. N. Khushaba, “Feature subset selection using differential evolution and a wheel based search strategy”. Swarm and Evolutionary Computation, vol.9, pp.15-26, 2013.
[35] S. Lee, H. Park, and M. Jeon, “Binary particle swarm optimization with bit change mutation, IEICE transactions on fundamentals of electronics, communications and computer sciences, vol.90, no.10, pp.2253-2256, 2007.
[36] G. Tsoumakas, I. Katakis and I. Vlahavas, “Effective voting of heterogeneous classifiers”. in European Conference on Machine Learning, 2004, pp. 465-476.
_||_[1] A. Antoniou, P. D. P. Pharoah, S. Narod, H. A. Risch, J. E. Eyfjord, J. L. Hopper and B. Pasini, “Average risks of breast and ovarian cancer associated with BRCA1 or BRCA2 mutations detected in case series unselected for family history: a combined analysis of 22 studies”, The American Journal of Human Genetics, vol.72, no.5, pp.1117-1130, 2003.
[2] L. C. Hartmann, D. J. Schaid, J. E. Woods, T. P. Crotty, J. L. Myers, P. G. Arnold and, M. H. Frost, “Efficacy of bilateral prophylactic mastectomy in women with a family history of breast cancer”, New England Journal of Medicine, vol.340no. 2, pp.77-84, 1999.
[3], M. C. King, , J. H. Marks and J. B. Mandell, “Breast and ovarian cancer risks due to inherited mutations in BRCA1 and BRCA2”, Science, vol.302, no.5645, pp.643-646, 2003.
[4] C. DeSantis., J. Ma, L. Bryan and, A. Jemal, “Breast cancer statistics, 2013”, CA: a cancer journal for clinicians, vol.64, no.1, pp.52-62, 2014.
[5] K. M. Kash, J. C. Holland, M. S. Halper and, D. G. Miller, “Psychological distress and surveillance behaviors of women with a family history of breast cancer”. JNCI: Journal of the National Cancer Institute, vol.84, no.1, pp.24-30, 1992.
[6], R. L. Siegel, , K. D. Miller and, A. Jemal, “Cancer statistics, 2015”, CA: a cancer journal for clinicians, vol.65, no.1, pp.5-29, 2015.
[7] E. C. Fear, X. Li, S. C. Hagness and, M. A. Stuchly, “Confocal microwave imaging for breast cancer detection: Localization of tumors in three dimensions”, IEEE Transactions on Biomedical Engineering, vol.49, no.8, pp.812-822, 2002.
[8] A. Asuncion and Newman, DUCI machine learning repository, (2007).
[9] مرزوقی, فاطمه و علی اصغر صفائی (۱۳۹۵)، مدلی برای تشخیص سرطان سینه مبتنی بر شبکه های عصبی، کنفرانس بین المللی مهندسی کامپیوتر و فناوری اطلاعات، تهران، دبیرخانه دایمی کنفرانس.
[10] شیخ پور, راضیه و مهدی آقاصرام (1394)، انتخاب ویژگی‌های موثر در تشخیص سرطان سینه با استفاده از مدل‌های پارامتریک یادگیری ماشین. فصلنامه علمی-پژوهشی بیماری های سینه, 8(2), 16-23.
[11] بهمن یار, حسن و بهزاد یثربی (۱۳۹۶)، انتخاب ویژگی های موثر برای تشخیص سرطان سینه با استفاده از الگوریتم شبکه عصبی مصنوعی با رویکرد تکاملی، کنفرانس ملی پژوهش های نوین در برق، کامپیوتر و مهندسی پزشکی، کازرون، دانشگاه آزاد اسلامی واحد کازرون.
[12] سندی, فاطمه؛ الهام عسکری؛ نرجس مطهری و پرستو شهابی چروده (۱۳۹۵)، مقایسه و ارزیابی تکنیک های داده کاوی در جهت تشخیص بهتر سرطان سینه، دومین کنفرانس بین المللی مدیریت و فناوری اطلاعات و ارتباطات، تهران، شرکت خدمات برتر.
[13] M. Nilashi, O. Ibrahim, H. Ahmadi and , L Shahmoradi, “A knowledge-based system for breast cancer classification using fuzzy logic method”, Telematics and Informatics, 34(4), pp.133-144, 2017.
[14], R. D. H. Devi, and, M. I. Devi, “Outlier detection algorithm combined with decision tree classifier for early diagnosis of breast cancer”. Int J Adv Engg Tech, vol. 6,no.2 , pp. 93-98, 2016.
[15] K. J. Wang, B. Makond, K. H. Chen, and, K. M. Wang, “A hybrid classifier combining SMOTE with PSO to estimate 5-year survivability of breast cancer patients”. Applied Soft Computing, 2016, pp.15-24.
[16] J. Diz, G. Marreiros, and A. Freitas, “Applying Data Mining Techniques to Improve Breast Cancer Diagnosis”. Journal of medical systems, vol.40, no.9, pp. 203-210, 2016.
[17] K. Vaidehi, and, T. S. Subashini, “Breast tissue characterization using combined K-NN classifier”, Indian Journal of Science and Technology, vol.8,no.1, pp. 23-26, 2015.
[18] A. Onan, “A fuzzy-rough nearest neighbor classifier combined with consistency-based subset evaluation and instance selection for automated diagnosis of breast cancer”, Expert Systems with Applications, vol.42, no.20, pp.6844-6852, 2015.
[19] R. Sheikhpour, M. A. Sarram, and, R. Sheikhpour , “Particle swarm optimization for bandwidth determination and feature selection of kernel density estimation based classifiers in diagnosis of breast cancer”, Applied Soft Computing, vol.40, pp.113-131, 2016.
[20] F. Ahmad, N. A. M. Isa, Z. Hussain, M. K. Osman, and S. N. Sulaiman, “A GA-based feature selection and parameter optimization of an ANN in diagnosing breast cancer”. Pattern Analysis and Application, vol.18, no.4, pp.861-870, 2015.
[21] MM. Kabir, MM. Islam and K. Murase, “A new wrapper feature selection approach using neural network”, Neurocomputing,vol. 73, pp. 3273–3283, 2010.
[22] G. L. Scott, and H. C. Longuet-Higgins, “Feature grouping by'relocalisation'of eigenvectors of the proximity matrix”. in BMVC,1990, pp. 1-6.
[23] Z. Kim and R. Nevatia, “Uncertain reasoning and learning for feature grouping”, Computer Vision and Image Understanding, vol.76, no.3, pp.278-288, 1999.
[24] G. Gan, and M. K. P. Ng, “Subspace clustering with automatic feature grouping” Pattern Recognition, vol.48, no.11, pp. 3703-3713, 2015.
[25] Breast Cancer Wisconsin (Original) dataset, UCI machine language repository, 1992.
[26] A. Marcano-Cedeño, J. Quintanilla-Domínguez and D. Andina, “WBCD breast cancer database classification applying artificial metaplasticity neural network”, Expert Systems with Applications, vol.38, no.8, pp. 9573-9579, 2011.
[27] MF. Akay, “Support vector machines combined with feature selection for breast cancer diagnosis”, Expert Syst Appl, vol.36, no.2, pp. 3240–3247, 2009.
[28] Y. Peng, Z. Wu, J. Jiang, “A novel feature selection approach for biomedical data classification”, J Biomed Inform, vol.43, no.1, pp.15–23, 2010.
[29] A. Marcano-Ceden˜o, J. Quintanilla-Domı´nguez and D. Andina, “WBCD breast cancer database classification applying artificial metaplasticity neural network”, Expert Syst Appl, vol.38, no.8, pp.9573–9579, 2011.
[30] M. Karabatak, MC. Ince, “An expert system for detection of breast cancer based on association rules and neural network”, Expert Syst Appl, vol.36, no.2, pp. 3465–3469, 2009.
[31] R. Stoean, C. Stoean, “Modeling medical decision making by support vector machines, explaining by rules of evolutionary algorithms with feature selection” Expert Syst Appl, vol.40, no.7, pp.2677–2686, 2013.
[32], V. Chaurasia, and, S. Pal, (2017). “A novel approach for breast cancer detection using data mining techniques”, International Journal of Innovative Research in Computer and Communication Engineering, vol.2, no.1, 2017.
[33] D. H. Wolpert, “Stacked generalization”, Neural networks, vol.5, no.2, 241-259, 1992.
[34] A. Al-Ani, A. Alsukker, and R. N. Khushaba, “Feature subset selection using differential evolution and a wheel based search strategy”. Swarm and Evolutionary Computation, vol.9, pp.15-26, 2013.
[35] S. Lee, H. Park, and M. Jeon, “Binary particle swarm optimization with bit change mutation, IEICE transactions on fundamentals of electronics, communications and computer sciences, vol.90, no.10, pp.2253-2256, 2007.
[36] G. Tsoumakas, I. Katakis and I. Vlahavas, “Effective voting of heterogeneous classifiers”. in European Conference on Machine Learning, 2004, pp. 465-476.
