شناسایی مولکولی باکتری استنوتروفوموناس مالتوفیلیا جدا شده از نمونه های بالینی و محیطی بیمارستان های کرمانشاه

محورهای موضوعی : میکروبیولوژی

سینا سادات امامی ¹ (دانشگاه ازاد اسلامی واحد تهران شمال)
جمیله نوروزی ² (دپارتمان میکروب شناسی، دانشگاه آزاد اسلامی واحد تهران شمال، تهران، ایران)
رامین عبیری ³ (دپارتمان میکروب شناسی، دانشگاه علوم پزشکی کرمانشاه، کرمانشاه، ایران)
پرویز مهاجری ⁴ (دپارتمان میکروب شناسی، دانشگاه علوم پزشکی کرمانشاه، کرمانشاه، ایران)

تاریخ دریافت : 1400/01/30 تاریخ پذیرش : 1400/03/15 تاریخ انتشار : 1399/06/01

کلید واژه: شناسایی مولکولی, عفونت بیمارستانی, ژن های خانه دار, استنوتروفوموناس مالتوفیلیا,

چکیده مقاله :

هدف: شناسایی مولکولی باکتری استنوتروفوموناس مالتوفیلیا جدا شده از نمونه های بالینی و محیطی بیمارستان های کرمانشاه روش کار: 500 نمونه بالینی و محیطی مختلف جمع آوری و توسط تست های بیوشیمیایی و PCR شناسایی شد. در مرحله بعد سویه های باکتری با تکثیر 7 لوکوس ژنی شامل atpD، gapA، guaA، mutM، nuoD، ppsA و recA مشخص و تعین توالی شد. رسم درخت فیلوژنی مربوط به سویه ها با نرم افزارMEGAv.7 صورت گرفت. نتایج: از میان500 نمونه جمع آوری شده از بیمارستان ها، تعداد 28 ایزوله استنوتروفوموناس مالتوفیلیا شناسایی شدند. از این میان 13 ایزوله مربوط به نمونه های محیطی (7 ایزوله (8/53%) از محیط های مرطوب و 6 ایزوله (2/46%) از محیط های خشک) و 15 ایزوله نیز مربوط به نمونه های بالینی (12 ایزوله (80%) از نمونه خلط بیماران و 3 ایزوله (20%) از خون بیماران) بودند. در تعداد اندکی سویه مشترک نیز میان نمونه های بالینی و محیطی یافت شد. بر اساس درخت فیلوژنی، 28 ایزوله جمع آوری شده مربوط به 21 سویه شناسایی شده از باکتری است که به دلیل شباهت ژنتیکی 100 % برخی از ایزوله ها بوده است. بحث و نتیجه گیری: تمام سویه های در حال گردش باکتری استنوتروفوموناس مالتوفیلیا در شهر کرمانشاه متعلق به یک الگوی ملکولی خاص بوده و از تنوع ژنتیکی بالایی برخوردار نمی باشند که احتمال آلودگی بیماران به باکتری را از طریق محیط های آلوده بیمارستانی افزایش می دهد. بنابراین استفاده از روش های ملکولی افتراقی با قدرت بالا به عنوان روش قابل قبول در کنترل این باکتری پیشنهاد می گردد

چکیده انگلیسی:

aim: the molecular similarity of S.maltophilia strains between patients and hospital environments in Kermanshah was studied Methods: 500 different clinical and environmental samples were collected and cultured for isolation and identification of S.maltophilia isolates using biochemical tests; then presence of 23srRNA gene was detected by PCR for molecular identification. Finally, by amplifying 7 housekeeping genes (including: atpD، gapA، guaA، mutM، nuoD، ppsA and recA) in relation with S.maltophilia bacterium, the strains of S.maltophilia isolates were determined. Then phylogenetic tree was drawn by Mega 7 software. Results: From 500 clinical and environmental samples collected from hospitals, 28 isolates of S.maltophilia were identified by biochemical methods and molecular confirmation. Among these, 13 isolates were obtained from environmental samples and the rest from clinical samples. A small number of common strains were also found between clinical and environmental samples. Phylogenetic tree analysis demonstrated that these 28 isolates belonged to 21 identified strains of the S.maltophilia, which was due to 100% genetic similarity of some isolates. Discussion: The molecular similarity of S.maltophilia strains between patients and hospital environment revealed that all strains of this bacterium in Kermanshah belong to a specific molecular pattern and do not have high genetic diversity and probably, this bacterium was transmitted from the hospital to patients. Therefore, observance of hygiene in hospital and employing the molecular methods with high differentiation is recommended to control the distribution of this bacterium.