تعیین ردیف نوکلئوتیدی و قرابت فیلوژنتیکی ژن Tax ویروس لوسمی گاو در ایران
محورهای موضوعی : آسیب شناسی درمانگاهی دامپزشکی
حسن ممتاز
1
*
,
پوریا امینی
2
,
بهنام عباسیان
3
1 - گروه میکروبیولوژی، دانشکده دامپزشکی، دانشگاه آزاد اسلامی واحد شهرکرد، شهرکرد، ایران
2 - دانشآموخته دامپزشکی، دانشکده دامپزشکی، دانشگاه آزاد اسلامی واحد شهرکرد، شهرکرد، ایران
3 - دانشآموخته دامپزشکی، دانشکده دامپزشکی، دانشگاه آزاد اسلامی واحد شهرکرد، شهرکرد، ایران
کلید واژه: ایران, ویروس لوسمی گاو, ژن Tax, قرابت فیلوژنتیکی,
چکیده مقاله :
ویروس لوسمی گاو (BLV) از خانواده رتروویریده،دون خانواده ارتورتروویرینه و جنس دلتارتروویروس واجد 3 ژن ساختمانی اصلی env، pol،gag و تعدادی ژن تنظیم کننده همانند سازی از جمله Tax، Rex، IIIR وC IVمی باشد. به منظور تعیین قرابت فیلوژنی ژن Tax ویروس BLV در نمونه های آلوده به این ویروس در ایران در ابتدا قطعه 927 جفت بازی ژن Tax از چهار نمونه آلوده در سیستم PCR تکثیر و جهت تعیین ردیف نوکلئوتیدی سکانس گردید. نتایج حاصل از مقایسه ردیف نوکلئوتیدی تعیین شده در این مطالعه با سکانس شناخته شده ژن Tax ویروس BLV در سایر کشورها نشانگر وجود 4/3 تا 7/7 درصد تنوع ژنتیکی در این ژن بود که در این میان بیشترین قرابت با ردیف نوکلئوتیدی ژن Tax در آمریکا )سکانس (AY700378.1 با 6/96 درصد تشابه و بیشترین تفاوت مربوط به جدایه این ویروس در استرالیا (سکانس AY700379.1) و ژاپن (سکانس AY700381.1) با 3/92 درصد قرابت مشاهده شد.
Bovine Leukosis Virus (BLV) belongs to the genus Deltaretrovirus ,subfamily Orthoretrovirinae of the family Retroviridae comprising 3 main genes of gag, pol and env and a number of replication regulatory genes such as Tax, Rex, R III, C IV. For determination of genetic relationship of Tax gene of BLV in Iran with those in other countries fragments 927bp corresponding to Tax from four infected samples were amplified in PCR system and sequenced for determining nucleotide sequence and compared with identified nucleotide sequence of this gene in other countries.A comparison made on Tax gene in Iran with other countries demonstrated 3.4 to 7.7% variability in Tax gene, of which the greatest sequence similarity exists between sequences of Tax in Iran with USA (AY700378.1)with 96.6% similarity and the least relationship exists between sequences of this virus in Iran with Australia (AY700379.1) and Japan (AY700381.1) with 92.3% similarity