کاربرد نشانگر ملکولی RAPDدر بررسی تنوع ژنتیکی کفشدوزک (Col.:Coccinellidae) Hippodamia variegata در استان لرستان
محورهای موضوعی : حشره شناسی و سایر بندپایان
مریم هاشمی
1
(زیست شناسی سلولی ملکولی، واحد بروجرد، دانشگاه آزاد اسلامی، واحد بروجرد، ایران)
فاطمه نبی‌‌پور
2
(باشگاه پژوهشگران جوان و نخبگان، واحد خرمآباد، دانشگاه آزاد اسلامی، خرمآباد، ایران)
رضا یاری
3
(گروه زیست‌شناسی، واحد بروجرد، دانشگاه آزاد اسلامی واحد بروجرد، ایران)
رضا جعفری
4
(گروه زراعت و اصلاح نباتات، واحد بروجرد، دانشگاه آزاد اسلامی واحد بروجرد، ایران)
کلید واژه: تنوع ژنتیکی, Genetic variation, RAPD, Hippodamia variegata, کنترل بیولوژیک, RAPD-PCR, نشانگر ملکولی,
چکیده مقاله :
کفشدوزک (Col.:Coccinellidae) Goeze Hippodamia variegata یکی از شکارگرهای مهم آفات در کشتزارهای ایران است. این شکارگر همه چیز خوار است و از شته ها و پسیل ها تغذیه می کند. مارکر RAPD نشانگر ژنتیکی مفیدی در بررسی تنوع ژنتیکی و چندشکلی در بین کفشدوزک ها می باشد. این تحقیق با هدف شناسایی و بررسی تنوع ژنتیکی جمعیت کفشدوزک Hippodamiavariegata در 9 جمعیت طبیعی و 2 جمعیت پرورش تجاری صورت پذیرفته است. برای بررسی تنوع ژنتیکی از 8 آغازگر10 نوکلئوتیدی تصادفی (C-15،C-16 ، C-18، C-19، BE-03، BE-09، B-01، B-06 ) استفاده گردید. تمامی آغازگرها باندهای واضح و تکرار پذیر ایجاد کردند. از 147 باند تولید شده 82 باند یعنی78/55% باند چند شکل بودند. طول قطعات تکثیر یافته در آغازگرها از 225 تا 20000 جفت باز متغیر بود. دندروگرام بر اساس ضریب تشابه جاکارد به روش UPGMA رسم گردید. نتایج حاصل از تجزیه خوشه ای، بیانگر وجود تفاوت ژنتیکی بالا در بین جمعیت های مورد مطالعه در سطح استان لرستان بود. پرایمر BE-09 (باند 28) بالاترین و پرایمر C-16 (باند 13) کمترین تعداد باند را تشکیل دادند. به طوری که تنها دو جمعیت دورود و خرم آباد آن هم با درصد بسیار کم (به میزان 285/0 با ضریب جاکارد) نخستین خوشه را تشکیل می دادند و سایر خوشه ها با درصد تشابه بسیار کم تشکیل شدند که این امر حاکی از مستعد بودن شرایط اکولوژی و جغرافیایی استان لرستان با وجود کوچک بودن سطح استان برای ایجاد و حفظ تنوع ژنتیکی در کفشدوزک های استان می باشد. [1] . Jaccards similarity coefficient [2] . Unweighted paired group method using aarithmetic average
Hippodamia variegata is one of the major predators of crop pests which feed an aphids and psyllids. RAPD is a useful genetically marker to determine polymorphism and relationship among LadyBirds species. The aim of this study was to identify and study the genetic diversity of Hippodamia variegata Goeze (Col.:Coccinellidae)in 9 natural populations and 2 commercial breeding populations. To investigate the genetic diversity of 8 primers, 10 randomized nucleotides (C-15, C-16, C-18, C-19, BE-03, BE-09, B-01, B-06) were used. All primers created clear and repeated bands. Of the 147 bands produced, 82 bands, 55.78 percent, were polymorphic. The length of amplified fragments by all primers varied from 225 to 2000 base pairs. The dendrogram was calculated based on the Jaccard similarity coefficient by UPGMA method. The results of cluster analysis indicated that there was a high genetic difference among the populations studied in Lorestan province. Primer BE-09 (28 bands) produced the highest and primer C-16(13 bands) produced the lowest number of bands. Two populations Dorud and Kuhdasht formed the first cluster close to 0.28 Jaccard coefficient of using UPGMA method. Other clusters formed a very low percentage of similarity. This shows that the susceptibility of the ecology and geography of the province despite the small size establishes and maintains the genetic diversity in the province of the ladybirds. The results of cluster analysis indicated high genetic differences between populations studied in the Lorestan province.
_||_