مدل داکینگ مولکولی ممانعت کننده های آدنوزین کیناز توکسوپلاسما گوندی

Subject Areas : Biotechnological Journal of Environmental Microbiology

Taraneh Zandi Asadabadi ^{1 *}

1 - گروه میکروبیولوژی ، دانشکده علوم پایه ، واحد لاهیجان ، دانشگاه آزاد اسلامی ، لاهیجان ، ایران

Received: 2022-03-10 Accepted : 2022-04-18 Published : 2022-03-01

Keywords: توکسوپلاسما گوندی, آدنوزین کیناز, طراحی دارو, مدل سازی QSAR, ویژگی های ADME,

Abstract :

رویکردهای کامپیوتری می تواند به عنوان پلی برای اکتشافات دارویی جدید در نظر گرفته شوند. در سال 2014، سازمان بهداشت جهانی مقاومت آنتی‌بیوتیکی در میکروارگانیسم‌ها را به عنوان یک تهدید بزرگ جهانی اعلام کرد. به همین دلیل بیماری‌های ساده که قبلا قابل کنترل بودند، اکنون به عفونت‌های کشنده تبدیل شده‌اند. مقاومت میکروبی شکلی از مقاومت دارویی است که در آن یک میکروارگانیسم ممکن است حتی زمانی که آنتی بیوتیک ها در محیط وجود دارد، زنده بماند. توکسوپلاسموزیس یک عفونت انگلی مهم در سراسر جهان است که توسط توکسوپلاسما گوندی ایجاد می شود. از آنجایی که توکسوپلاسما گوندی قادر به سنتز باز پورین نیست، پروتئین آدنوزین کیناز (EC.2.7.1.20) یک آنزیم مهم در مسیر زندگی این ارگانیسم است. به همین علت، آدنوزین کیناز اخیراً به عنوان هدفی برای تولید عوامل ضد توکسوپلاسموزیس در نظر گرفته می شود. این مطالعه با هدف توسعه یک مدل سه بعدی برای پیش‌بینی فعالیت مهارکننده‌های آدنوزین کیناز در توکسوپلاسما گوندی و یافتن مهارکننده‌های موثر جدید انجام شد. مقادیر قابل قبول 98/0، 83/0، و 91/0 به ترتیب برای شاخص های نیکویی برازش (R2)، اعتبار متقاطع داخلی (Q2) و اعتبار متقاطع خارجی (R2pred) مشاهده شد. انسجام مدل با استفاده از تجزیه و تحلیل Y-scrambling تایید شد و مقادیر 18/0~ و 0025/0~ به ترتیب برای R2intercept و Q2intercept مشاهده شد. این امر تأیید می کند که شاخص های محاسبه شده برای مدل اصلی بر اساس همبستگی شانسی بین متغیرهای مستقل و وابسته نبوده است. پس از غربالگری مجازی با استفاده Swiss Similarity در پایگاه داده ZINC، لیگاندهای جدید پیشنهاد شدند. Swiss ADME برای پیش‌بینی خواص فارماکوکینتیک ترکیبات جدید استفاده شد و یک ترکیب دارای پتانسیل مهاری مناسب برای تحقیقات بیشتر پیشنهاد شد.