معرفي نشريه
علمی
مجله زیستفناوری میکروارگانیسمهای محیطی یک مجله با انجام مراحل داوری است که مقالات حاصل از تحقیقات اصلی باکیفیت بالا را بررسی و به چاپ میرساند. مقالات مروری کامل و مروری کوتاه و مقالات ارتباط کوتاه (Short communications) نیز مورد پذیرش است. این مجله تمام جنبههای تحقیقاتی مربوط به کاربردهای زیستفناوری میکروارگانیسمها در محیطهای مختلف مانند هوا، خاک و آب پوشش میدهد. موضوعات مورد توجه شامل میکروارگانیسمهای مهم محیطی در حوزههای زیستفناوری سبز، سفید و آبی هستند. مطالعات بر روی جداسازی و شناسایی هرگونه جدید میکروبی از مناطق مختلف جغرافیایی محلی با کاربرد بالقوه در زیستفناوری مانند زیست پالائی یا تجزیه زیستی آلایندهها در محیطهای مختلف مورد توجه قرار میگیرد. ساختار و عملکرد آنزیمها و پروتئینها یا بیوسنتز متابولیت های قارچی، جلبکی و باکتریایی و سموم مهم داری اثر در محیط زیست و همچنین موضوعات مربوط به فرسایشهای میکروبی، معدنی سازی مواد آلی، میکروبیولوژی نفت، میکروبیولوژی زیر سطح، شکل و عملکرد بیوفیلم و سایر پدیدههای سطحی، چرخه بیوژئوشیمیایی عناصر و میکروبشناسی آثار باستانی قابل توجه است. مطالعات متاژنومیکس و هرگونه پیشرفت بیوانفورماتیک مربوط به جوامع میکروبی در محیطهای مختلف نیز در حوزه این مجله پوشش داده میشود.
مجله زیست فناوری میکروارگانیسم های محیطی در ارزیابی نشریات علمی دانشگاه آزاد اسلامی، دارای رتبه "ب" (B) می باشد.
-
دسترسی آزاد مقاله
1 - پویایی فصلی تنوع قارچی اندوفیت درختان Grevillea robusta (بلوط نقره ای)
ابراهیم طالبی گریما آلتایه آشفت آگیتهشماره 5 , دوره 2 , بهار 1402این مطالعه به بررسی تأثیر تغییرات فصلی بر تنوع قارچهای اندوفیت بر روی شاخ و برگ درختان Grevillea robusta در امتداد بزرگراهها در هاواسا، اتیوپی میپردازد. با 765 جدایه قارچی که به 73 مورفوتاکسای متمایز طبقه بندی شدند، 41/90٪ در هشت جنس شناخته شده شناسایی گردیدند، و 58/ چکیده کاملاین مطالعه به بررسی تأثیر تغییرات فصلی بر تنوع قارچهای اندوفیت بر روی شاخ و برگ درختان Grevillea robusta در امتداد بزرگراهها در هاواسا، اتیوپی میپردازد. با 765 جدایه قارچی که به 73 مورفوتاکسای متمایز طبقه بندی شدند، 41/90٪ در هشت جنس شناخته شده شناسایی گردیدند، و 58/9٪ ناشناس باقی ماندند. شایان ذکر است، Phoma و Pestalotiopsis به عنوان متنوعترین جنسها ظاهر شدند که به ترتیب 13 و 11 مورفوتاکسا را نشان دادند. در حالی که Alternaria و Xylaria تنوع کمتری را با 3 و 2 morphotaxa نشان دادند. این تحقیق تعداد و تنوع قارچها را در درختانی که در محیطهای آلودهتر قرار داشتند، برگهای نمونهبرداری شده در فصول خشک، آنهایی که علائم بیماری را بروز نمودند، بخشهای پایین برگ و نمونههای میانی را نشان داد. این یافتهها بر مجموعهای غنی از قارچهای اندوفیت مرتبط با برگهای Grevillea robusta در مزارع کنار جادهای در هاواسا تأکید میکند و نیاز به کاوش بیشتر در پویایی این جامعه قارچی است. درک نقش محوری این قارچهای اندوفیت در سلامت درختان، انعطافپذیری اکوسیستم و کاربردهای بالقوه در کشاورزی، جنگلداری و بیوتکنولوژی ضروری است. پرونده مقاله -
دسترسی آزاد مقاله
2 - جداسازی و شناسایی ویژگیهای ضد میکروبی اکتینومیستهای بومی جدا شده از خاک های کشاورزی استان گیلان
الهام امیری میر ساسان میر پور خسرو عیسی زاده بهنام راستیشماره 5 , دوره 2 , بهار 1402اکتینومیست ها به عنوان بزرگترین مخزن آنتی بیوتیک های طبیعی در جهان شناخته می شوند. هدف از این تحقیق جداسازی و شناسایی مولکولی اکتینومیست ها با خاصیت ضدمیکروبی ازخاکهای کشاورزی مناطق بومی استان گیلان می باشد. نمونه های خاک از مناطق کشاورزی جنوب غربی استان گیلان جمع آ چکیده کاملاکتینومیست ها به عنوان بزرگترین مخزن آنتی بیوتیک های طبیعی در جهان شناخته می شوند. هدف از این تحقیق جداسازی و شناسایی مولکولی اکتینومیست ها با خاصیت ضدمیکروبی ازخاکهای کشاورزی مناطق بومی استان گیلان می باشد. نمونه های خاک از مناطق کشاورزی جنوب غربی استان گیلان جمع آوری شدند. برای جداسازی اکتینومیست ها از رقیق سازی متوالی استفاده گردید. سپس به شناسایی مورفولوژی، فیزیولوژی و بیوشیمیایی نمونه ها پرداخته شد و در نهایت شناسایی مولکولی ایزوله ها با استفاده از توالی یابی 16S rRNA و تجزیه و تحلیل فیلوژنتیک انجام گرفت. بررسی فعالیت ضدمیکروبی در برابر میکروارگانیسم های پاتوژن انجام گردید. در مجموع 14 ایزوله شناسایی شد. 2 ایزوله با خاصیت ضد میکروبی بیشتر انتخاب شد. براساس نتایج مطالعات فیلوژنتیکی و توالی یابی 16S rRNA سویه Amycolatopsis roodepoortensis Strain EA7 با 63/99% اطمینان و سویه EA6 Streptomyces Microfluve Strain با 92/93 % اطمینان شناسایی شدند.باکتری های جدا سازی شده دارای فعالیت ضدمیکروبی بیشترعلیه میکروارگانیسم های پاتوژن گرم مثبت Staphylococcus aureus و نمونه استاندارد PTCC 1112 بودند. این تحقیق اولین گزارش از شناسایی اکتینومیست ها با خاصیت ضد میکروبی در خاکهای کشاورزی مناطق جنوب غربی استان گیلان واقع در کوههای البرز می باشد. شناسایی سویه نادرroodepoortensis Strain EA7 Amycolatopsis از مناطق شمالی ایران خاک های این مناطق را بسیار ارزشمند می سازد. پرونده مقاله -
دسترسی آزاد مقاله
3 - مشخصه یابی نانو ساختارهای اکسید ساماریوم خالص و دارای گرافن تهیه شده به روش هیدرو ترمال به عنوان یک عامل بالقوه ضد میکروبی
عباس باقری خطیبانی سمیه سعادت نیاول سمانه رسولی جمنانی حسین میلانی مقدمشماره 5 , دوره 2 , بهار 1402کاربردهای فریبنده و چشمگیر مواد مبتنی بر اکسید ساماریم در علم نیمه هادی ها، علاقه به سنتز و مطالعه خواص فیزیکی آنها را ایجاد کرد. بنابراین، پس از تهیه اکسید ساماریوم خالص و پودرهای گرافن/اکسید ساماریوم از طریق تکنیک هیدروترمال با استفاده از پراش اشعه ایکس (XRD)، میکروسک چکیده کاملکاربردهای فریبنده و چشمگیر مواد مبتنی بر اکسید ساماریم در علم نیمه هادی ها، علاقه به سنتز و مطالعه خواص فیزیکی آنها را ایجاد کرد. بنابراین، پس از تهیه اکسید ساماریوم خالص و پودرهای گرافن/اکسید ساماریوم از طریق تکنیک هیدروترمال با استفاده از پراش اشعه ایکس (XRD)، میکروسکوپ الکترونی روبشی نشر میدانی (FESEM)، طیفسنجی فروسرخ تبدیل فوریه (FTIR)، طیفسنجی رامان، و طیفسنجی UV-Visible، خواص ساختاری، نوری و مورفولوژیکی نمونه ها مورد ارزیابی قرار گرفته است. با استفاده از XRD، ثابت های شبکه و برخی پارامترهای ساختاری مرتبط تعیین شد. تغییر گاف نواری اپتیکی نیز با کمک جذب محاسبه شده است. دادههای XRD نشان داد که فاز مکعبی اکسید ساماریوم در هر دو نمونه غالب است، حتی اگر یک پیک پراش شدید گرافن در نمونه گرافن/اکسید ساماریوم مشاهده شود. تجزیه و تحلیل SEM، Raman و FTIR، اثرات افزودن گرافن را بر شبکه اصلی اکسید ساماریوم نشان داد. علاوه بر این، کاهش گاف نواری اپتیکی ناشی از گرافن نیز قابل توجه بود. پرونده مقاله -
دسترسی آزاد مقاله
4 - بیماری زایی و سقط جنین خودبخودی ناشی از لیستریا مونوسیتوژنز : گزارش کوتاه
مانوش زنده دل سمانه کاظمی امیررضا حاجتی ضیابریشماره 5 , دوره 2 , بهار 1402لیستریا مونوسیتوژنز به عنوان یکی از پاتوژن های غذایی، عامل ایجاد لیستریوز است. لیستریا در همه جای محیط زیست وجود دارد و می تواند بیوفیلم هایی را در محیط تولید مواد غذایی ایجاد کند، و بنابراین می تواند غذاهای آماده به طبخ (RTE) را که معمولاً به صورت خام یا بدون پردازش بی چکیده کامللیستریا مونوسیتوژنز به عنوان یکی از پاتوژن های غذایی، عامل ایجاد لیستریوز است. لیستریا در همه جای محیط زیست وجود دارد و می تواند بیوفیلم هایی را در محیط تولید مواد غذایی ایجاد کند، و بنابراین می تواند غذاهای آماده به طبخ (RTE) را که معمولاً به صورت خام یا بدون پردازش بیشتر مصرف می شوند، آلوده کند. لیستریا مونوسیتوژنز یک باکتری سازگار با محیط است. یکی از مهم ترین ویژگی های آن تحمل سرما و مقاومت آن در برابر غلظت نمک بالا و pH پایین است. از سوی دیگر، این باکتری یک پاتوژن مهم در زنان باردار، نوزادان، افراد مسن، افراد دارای نقص ایمنی و بیماران مبتلا به سرطان است. سقط جنین خودبخودی به از دست دادن جنین قبل از هفته بیستم بارداری گفته می شود که به طور طبیعی و بدون هیچ گونه مداخله جراحی یا دارویی اتفاق می افتد. براساس مطالعات قبلی به نظر می رسد که بروز لیستریا مونوسیتوژنز در بین زنان باردار بالا باشد. می توان نتیجه گرفت که زنان باردار و مراقبین سلامت آنها باید در مورد لیستریوز در دوران بارداری مطلع شوند. پرونده مقاله -
دسترسی آزاد مقاله
5 - بررسی تاثیر کورکومین انکپسوله در نانوذرات پلیمرزومی بر بیان ژن افلاکس پمپ MDR1 در جدایه های کاندیدا آلبیکنس مقاوم به فلوکونازول
سحر پوراصغر آیدا بجاری مهکامه هدایت صفا مهدی شهریاری نور نجمه رنجیشماره 5 , دوره 2 , بهار 1402کورکومین، یک ترکیب طبیعی از زردچوبه است که به عنوان یک عامل ضدباکتریایی و ضدقارچی شناخته می شود. کاندیدا آلبیکنس یکی از پاتوژنهای قارچی مهم با میزان کشندگی بالا در بیماران با نقص ایمنی است. شایع ترین پاتوژن فرصتطلب قارچی است که مصرف پیوسته ضد قارچها در درمان آن منجر چکیده کاملکورکومین، یک ترکیب طبیعی از زردچوبه است که به عنوان یک عامل ضدباکتریایی و ضدقارچی شناخته می شود. کاندیدا آلبیکنس یکی از پاتوژنهای قارچی مهم با میزان کشندگی بالا در بیماران با نقص ایمنی است. شایع ترین پاتوژن فرصتطلب قارچی است که مصرف پیوسته ضد قارچها در درمان آن منجر به ظهور و افزایش مقاومت چنددارویی شده است. در این مطالعه اثر کورکومین محبوسشده در نانوذرات پلیمرزومی و فلوکونازول بر بیان ژن MDR1 در جدایههای کاندیدا آلبیکنس مقاوم به دارو ارزیابی شد. در این مطالعه مقطعی توصیفی، 50 نمونه بالینی از زنان با عفونت ولووواژینیت از بیمارستان الزهرا (رشت) تهیه شد. بعد از تعیین هویت جدایه ها، مقاومت به فلوکونازول به روش انتشار از دیسک و براث دایلوشن بررسی شد. شش جدایه کاندیدا آلبیکنس مقاوم به فلوکونازول، تحت تیمار با فلوکونازول به تنهایی (1/2MIC) (نمونه شاهد) و در ترکیب با کورکومین محبوسشده در نانوذرات (نمونه تست) قرار گرفت. بعد از 24 ساعت، دو گروه سلولی جهت تخمین نرخ مرگ سلولی در محیط کشت سابوروددکستروز آگار کشت داده شد. بیان ژن MDR1 بطور کمی به روش Q-RT-PCR در سلول های تیمارشده و تیمارنشده با کورکومین مورد بررسی قرارگرفت. نتایج ما نشان داد که درمان ترکیبی فلوکونازول (1/2MIC) و کورکومین محبوسشده در نانوذرات(400µg/ml) طی 24 ساعت رشد قارچی را تا 50% کاهش داد. در سلولهای تیمارشده با کورکومین، آنالیز Q-RT-PCR کاهش بیان ژن MDR1 را در مقایسه با سلولهای تیمارنشده با کورکومین نشان داد. به نظر می رسد کورکومین بتواند از طریق کاهش بیان ژن MDR1 در جدایههای مقاوم به فلوکونازول، اثربخشی قلوکونازول را افزایش دهد. پرونده مقاله
-
دسترسی آزاد مقاله
1 - پویایی فصلی تنوع قارچی اندوفیت درختان Grevillea robusta (بلوط نقره ای)
ابراهیم طالبی گریما آلتایه آشفت آگیتهشماره 5 , دوره 2 , بهار 1402این مطالعه به بررسی تأثیر تغییرات فصلی بر تنوع قارچهای اندوفیت بر روی شاخ و برگ درختان Grevillea robusta در امتداد بزرگراهها در هاواسا، اتیوپی میپردازد. با 765 جدایه قارچی که به 73 مورفوتاکسای متمایز طبقه بندی شدند، 41/90٪ در هشت جنس شناخته شده شناسایی گردیدند، و 58/ چکیده کاملاین مطالعه به بررسی تأثیر تغییرات فصلی بر تنوع قارچهای اندوفیت بر روی شاخ و برگ درختان Grevillea robusta در امتداد بزرگراهها در هاواسا، اتیوپی میپردازد. با 765 جدایه قارچی که به 73 مورفوتاکسای متمایز طبقه بندی شدند، 41/90٪ در هشت جنس شناخته شده شناسایی گردیدند، و 58/9٪ ناشناس باقی ماندند. شایان ذکر است، Phoma و Pestalotiopsis به عنوان متنوعترین جنسها ظاهر شدند که به ترتیب 13 و 11 مورفوتاکسا را نشان دادند. در حالی که Alternaria و Xylaria تنوع کمتری را با 3 و 2 morphotaxa نشان دادند. این تحقیق تعداد و تنوع قارچها را در درختانی که در محیطهای آلودهتر قرار داشتند، برگهای نمونهبرداری شده در فصول خشک، آنهایی که علائم بیماری را بروز نمودند، بخشهای پایین برگ و نمونههای میانی را نشان داد. این یافتهها بر مجموعهای غنی از قارچهای اندوفیت مرتبط با برگهای Grevillea robusta در مزارع کنار جادهای در هاواسا تأکید میکند و نیاز به کاوش بیشتر در پویایی این جامعه قارچی است. درک نقش محوری این قارچهای اندوفیت در سلامت درختان، انعطافپذیری اکوسیستم و کاربردهای بالقوه در کشاورزی، جنگلداری و بیوتکنولوژی ضروری است. پرونده مقاله -
دسترسی آزاد مقاله
2 - اثرات نانوذرات کیتوزان بر موش های آلوده به لیستریا مونوسیتوژنز
سارا کاظمی راد میر ساسان میرپور مهدی آسمار محمدرضا رضویشماره 4 , دوره 1 , زمستان 1401لیستریا مونوسیتوژنز عامل بیماری لیستریوز است که عوارض زیادی به خصوص در زنان باردار دارد. با توجه به مقاومت آنتی بیوتیکی این باکتری، تلاش های زیادی برای معرفی ترکیبات دارویی مختلف از جمله نانوذرات مبتنی بر ترکیبات بیولوژیکی صورت گرفته است. این تحقیق با هدف بررسی مکانیسم چکیده کامللیستریا مونوسیتوژنز عامل بیماری لیستریوز است که عوارض زیادی به خصوص در زنان باردار دارد. با توجه به مقاومت آنتی بیوتیکی این باکتری، تلاش های زیادی برای معرفی ترکیبات دارویی مختلف از جمله نانوذرات مبتنی بر ترکیبات بیولوژیکی صورت گرفته است. این تحقیق با هدف بررسی مکانیسم اثر نانوذرات کیتوزان بر لیستریا مونوسایتوژنز در بدن یک موجود زنده انجام شد. سویه استاندارد لیستریا مونوسایتوژنز (ATCC 7644) در آزمایشگاه بیمارستان دی (ایران) تهیه و مورد تجزیه و تحلیل قرار گرفت. باکتری ها بر اساس آزمایش های بیوشیمیایی مورد بررسی قرار گرفتند. سپس فعالیت ضد باکتریایی غلظتهای 4.88 تا 5000 میکروگرم بر میلیلیتر نانوذرات کیتوزان در برابر استاندارد لیستریا مونوسیتوژنز (ATCC 7644) با روشهایی مورد بررسی و کمترین غلظتهای بازدارنده و باکتریکشی (به ترتیب MIC و MBC) محاسبه شد. اثرات غلظتهای مختلف نانوذرات و آمپیسیلین در موشهای آلوده به باکتری نیز مورد بررسی قرار گرفت. در موشهای آلوده، اثر درمانی با افزایش غلظت نانوذرات افزایش یافت و غلظت 156.25 میکروگرم بر میلیلیتر در مقایسه با سایر تیمارها مؤثرترین بود. همچنین، آمپی سیلین (10 میکروگرم) و نانوذرات کیتوزان با غلظت 39.06 میکروگرم بر میلیلیتر تقریباً اثر درمانی مشابهی داشتند. با شناسایی به موقع آلودگی لیستریا در زنان باردار و استفاده مناسب از نانوذرات کیتوزان به جای داروهای رایج، می توان راه حل جدیدی برای درمان لیستریوز پیدا کرد. پرونده مقاله -
دسترسی آزاد مقاله
3 - جداسازی و شناسایی خصوصیات باکتری های همزیست- بیماریزا جدا شده از گیاه شبدر ایرانی
نازنین موذن پور منیر دودی لادن رحیم زاده ترابی محمد حسین پزندهشماره 4 , دوره 1 , زمستان 1401بیماریهای گیاهی چه به صورت همهگیریهای نامنظم و چه آسیبهای منظم اثرات مخربی بر گیاهان و عملکرد آنها میگذارند. باکتری هایی نظیر اروینیا، پکتوباکتریوم و کلبسیلا دارای محدوده میزبانی بسیار گسترده ای بوده و می توانند برای تعداد زیادی از گیاهان زینتی و زراعی نقش بیماریزا چکیده کاملبیماریهای گیاهی چه به صورت همهگیریهای نامنظم و چه آسیبهای منظم اثرات مخربی بر گیاهان و عملکرد آنها میگذارند. باکتری هایی نظیر اروینیا، پکتوباکتریوم و کلبسیلا دارای محدوده میزبانی بسیار گسترده ای بوده و می توانند برای تعداد زیادی از گیاهان زینتی و زراعی نقش بیماریزایی داشته باشند یا حتی یک رابطه بیماریزای همزیستی با گیاه برقرار کنند. این دسته باکتریهای مولد انواع بیماری های گیاهی قادرند بر روی غده های بذری و جامعه میکروبی خاک اثر بگذارند. این مطالعه با هدف بررسی و تحلیل مولکولی پاتوژن های همزیست خاص مرتبط با گیاه شبدر ایرانی از منطقه شهرضا در بخش جنوبی اصفهان انجام شد. در این تحقیق، نمونههای گیاه شبدر ایرانیTrifolium resupinatum که دارای ساختار ریشههای گرهدار بودند، ابتدا جداسازی و سپس جهت غربالگری از نقاط مختلف منطقه جنوب اصفهان (شهرضا) جمع آوری و به آزمایشگاه تحقیقاتی واحد فلاورجان منتقل شدند. از محیط کشت مخمر مانیتول آگار برای شناسایی اولیه ایزوله ها استفاده شد. پس از آن نمونههای باکتریایی با استفاده از تستهای مورفولوژیکی، بیوشیمیایی و مولکولی (روش کلنی-PCR) مورد شناسایی قرار گرفتند. یافته های این مطالعه ویژگی های مولکولی سه گونه مجزا به نام های اروینیا کریزانتمی، پکتوباکتریوم کاروتووروم و کلبسیلا اکسی توکا را مشخص کرد. نتایج نشان داد که دو گونه اول یک رابطه بیماریزای همزیستی با گیاه شبدر ایرانی T. resupinatum نشان دادند، در حالی که گونه دوم تهدیدی برای سلامت انسان به عنوان یک پاتوژن بود. پرونده مقاله -
دسترسی آزاد مقاله
4 - بررسی اثرات ضدباکتریایی عصاره متانولی جوزهندی علیه جدایه های کلبسیلا پنومونیه و اسینتوباکتر بومانی مولد بتالاکتاماز وسیع الطیف
الهام نیکویی اشرف کریمی نیکشماره 4 , دوره 1 , زمستان 1401افزایش سویه های مختلف باکتریایی مقاوم به آنتی بیوتیک های مختلف تبدیل به یکی از نگرانی های اصلی سازمان بهداشت جهانی شده است. اخیرا مقاومت باکتریایی از طریق تولید بتالاکتامازهای با طیف وسیع در حال افزایش است و به عنوان یک مشکل درمانی جهانی مطرح می شود لذا تلاش برای اس چکیده کاملافزایش سویه های مختلف باکتریایی مقاوم به آنتی بیوتیک های مختلف تبدیل به یکی از نگرانی های اصلی سازمان بهداشت جهانی شده است. اخیرا مقاومت باکتریایی از طریق تولید بتالاکتامازهای با طیف وسیع در حال افزایش است و به عنوان یک مشکل درمانی جهانی مطرح می شود لذا تلاش برای استفاده از داروهای با منشا گیاهی، برضد باکتری های با مقاومت دارویی اهمیت ویژه ای یافته است.هدف از این مطالعه تعیین اثرات ضدباکتریایی عصاره متانولی جوزهندی علیه جدایه های کلبسیلا پنومونیه و اسینتوباکتر بومانی مولد بتالاکتاماز وسیع الطیف انجام گرفت. برای تهیه عصاره متانولی گیاه از روش ماسراسیون استفاده شد سپس عصاره با کاغذ واتمن شماره یک فیلتر ، و با استفاده از سیستم تقطیر در خلا دوار تغلیظ و خشک گردید. غلظتهای مختلف 80، 40، 20، 10، 5، 5/2، 25/1 و 625/0 میلی گرم بر میلی لیتر از عصاره در حلال دیمتیل سولفوکساید و متانول با حجم برابر تهیه گردید.از مجموع 100 ایزوله باکتریایی، جدایههای مولد بتالاکتاماز به روش فنوتیپی با دیسکهای آنتیبیوتیکی سفوتاکسیم و دیسک ترکیبی سفوتاکسیم/کلاولونیک اسید شناسایی شدند. بر اساس نتایج حاصله، از 60 باکتری کلبسیلا پنومونیه 33 درصد(20 ایزوله) و از 40 باکتری اسینتوباکتر بومانی 50درصد(20ایزوله) از جدایهها مولد بتالاکتاماز بودند. فعالیت ضدباکتریایی بر علیه 20 ایزوله از کلبسیلا پنومونیه و 20ایزوله از اسینتوباکتر بومانی مولد بتالاکتاماز به روش انتشار چاهک بررسی شد. پس از انکوباسیون به مدت 24 ساعت در دمای 37 درجه سانتیگراد میزان حساسیت باکتریها، با اندازهگیری قطر هاله بازدارندگی از رشد تعیین شد. کلیه ایزولههای کلبسیلا پنومونیه و اسینتوباکتر بومانی به عصاره گیاه جوزهندی حساسیت نشان دادند و میانگین حداقل غلظت بازدارندگی از رشد نسبت به کلبسیلا پنومونیه و اسینتوباکتر بومانی مولد بتالاکتاماز به ترتیب 10 و 5 میلیگرم بر میلیلیتر بود. بر اساس نتایج حاصل از این پژوهش، می توان نتیجه گرفت عصارهی گیاه جوزهندی در شرایط آزمایشگاهی قابلیت مهار باکتری های کلبسیلا و اسینتوباکتر را دارد و بر این اساس شاید بتوان در آینده با تحقیقات بیشتر و شناسایی ترکیبات موثر، از این عصاره، به عنوان جایگزین آنتی بیوتیکی جهت درمان ، استفاده کرد. پرونده مقاله -
دسترسی آزاد مقاله
5 - آنالیز این-سیلیکو از فضای برهمکنش شیمیایی ایجاد شده توسط دیکلوفناک سدیم و رسپتورهای کوروم سنسینگ Las در سودوموناس آئروژینوزا
شیرین شاهنگیانشماره 4 , دوره 1 , زمستان 1401بیشتر خصوصیات بیماری زایی سودوموناس آئروژینوزا که یک باکتری گرم منفی فرصت طلب است، توسط سیستم های سنجش حد نصاب آن کنترل می شود. بنابراین، مسدود کردن مسیرهای سنجش حد نصاب می تواند به عنوان یک استراتژی مناسب برای مقابله با سودوموناس آئروژینوزا استفاده شود. داروهای ضد الته چکیده کاملبیشتر خصوصیات بیماری زایی سودوموناس آئروژینوزا که یک باکتری گرم منفی فرصت طلب است، توسط سیستم های سنجش حد نصاب آن کنترل می شود. بنابراین، مسدود کردن مسیرهای سنجش حد نصاب می تواند به عنوان یک استراتژی مناسب برای مقابله با سودوموناس آئروژینوزا استفاده شود. داروهای ضد التهاب غیر استروئیدی از جمله محبوب ترین مواد شیمیایی مورد استفاده در درمان عفونت های میکروبی هستند. در مطالعه حاضر، فضای برهمکنش شیمیایی دیکلوفناک سدیم، یک داروی ضدالتهاب غیراستروئیدی معروف، در مقابله با دو گیرنده اصلی سیستم سنجش حد نصاب در سودوموناس آئروژینوزا (LasI و LasR) بررسی شده است. ساختارهای بهینه شده لیگاندها و گیرندهها با استفاده از AutoDock Vina که بخشی از نرمافزار PyRx است، تحت شبیهسازی داکینگ مولکولی قرار گرفتند. نتایج به دستآمده از داکینگ مولکولی و تحلیل فضای برهمکنشی، انرژیهای اتصال مناسبی را برای دیکلوفناک سدیم در مقابله با هر دو گیرنده نشان داد. اگرچه، انرژی اتصال دیکلوفناک سدیم برای گیرنده LasR منفی تر بود که نشان دهنده میل ترکیبی بالاتر دیکلوفناک سدیم برای این گیرنده است. در نهایت، بر اساس نتایج بدست آمده، پیشنهاد میشود که دیکلوفناک سدیم پتانسیل خوبی برای اتصال به هر دو گیرنده دارد، که این به نوبه خود می تواند با کاهش بیان برخی از ژن های مربوط به فاکتورهای بیماری زایی همراه باشد. بنابراین، دیکلوفناک سدیم را می توان به عنوان یک مهارکننده بالقوه برای سیستم حد نصاب در سودوموناس آئروژینوزا در نظر گرفت. پرونده مقاله -
دسترسی آزاد مقاله
6 - بهینه سازی تولید آنزیم های پلی فنل اکسیداز و پراکسیداز توسط سویه های بومی باسیلوس جداسازی شده از چای تخمیری
محمد فائزی قاسمیشماره 1 , دوره 1 , بهار 1401چای (Camellia sinensis) گونه ای از درختچه های همیشه سبز یا درختان کوچک از خانواده گیاهان گلدار Theaceae است. یکی از مراحل اصلی در تولید چای سیاه، فرآیند تخمیر است که در آن باکتری ها می توانند نقش داشته باشند. این مطالعه با هدف استفاده از روش تغییر یک فاکتور در یک زمان چکیده کاملچای (Camellia sinensis) گونه ای از درختچه های همیشه سبز یا درختان کوچک از خانواده گیاهان گلدار Theaceae است. یکی از مراحل اصلی در تولید چای سیاه، فرآیند تخمیر است که در آن باکتری ها می توانند نقش داشته باشند. این مطالعه با هدف استفاده از روش تغییر یک فاکتور در یک زمان (OFAT) و طراحی آزمایش ها به روش تاگوچی برای بهینه سازی تولید پلی فنل اکسیداز (PPO) و پراکسیداز (POD) توسط باسیلوس گونه انجام شد. نتایج نشان داد که ساکارز و گلوکز بیشترین تأثیر را بر تولید آنزیم های پلی فنل اکسیداز و پراکسیداز توسط سویههای باسیلوس جدا شده از چای کاملاً تخمیر شده از خود نشان دادند.;این سویه هابه ترتیب Bacillus sp. (TB3);و B. licheniformis (TB14);بودند. علاوه بر این، نتایج نشان داد که بهترین منابع نیتروژن برای تولید PPO توسط Bacillus sp. (TB3) و POD توسط licheniformis (TB14) B.; به ترتیب نیترات سدیم و کربنات آمونیوم بودند. بر اساس نتایج بهدستآمده، اجزای محیط برای تولید PPO توسط Bacillus sp. (TB3) در pH 7 به شرح زیر بود: 0.5٪ ساکارز، 1٪ پپتون، 0.8٪ عصاره مخمر، 0.2٪ کازئین هیدرولیز شده، 00.2٪ پتاسیم دی هیدروژن فسفات،0.005٪ از منیزیم سولفات 1٪ و هپتاهیدرات. نیترات سدیم. علاوه بر این، محیط کشت بهینه برای تولید POD توسط B. licheniformis (TB14) در pH 7 به شرح زیر بود: 0.3٪ گلوکز، 1٪ پپتون، 0.8٪ عصاره مخمر، 0.2٪ کازئین هیدرولیز شده، 0.02٪ درصد پتاسیم دی هیدروژن فسفات و0.005 درصد هپتا هیدرات سولفات منیزیم. افزایش تولید آنزیم PPO و POD به ترتیب حدود 8 و 6 برابر بیشتر از محیط کشت پایه بود. پرونده مقاله -
دسترسی آزاد مقاله
7 - میکروپلاستیک های دریایی سطحی جدید برای کلونیزیشن، تشکیل بیوفیلم و تجزیه زیستی
ناهید معصومی سید رضا حسینی دوست مرتضی عزیزالهی مریم میان آبادیشماره 2 , دوره 1 , تابستان 1401میکروپلاستیک ها (MPs) در اقیانوس حامل مجموعه های میکروبی هستند و هنگامی که در اقیانوس رها می شوند به سرعت توسط میکروب ها احاطه می شوند. نقش برهمکنش های میکروبی با میکروپلاستیک ها در اکوسیستم های دریایی اخیراً به تفصیل بررسی شده و حضور میکروپلاستیک ها در محیط های دریایی چکیده کاملمیکروپلاستیک ها (MPs) در اقیانوس حامل مجموعه های میکروبی هستند و هنگامی که در اقیانوس رها می شوند به سرعت توسط میکروب ها احاطه می شوند. نقش برهمکنش های میکروبی با میکروپلاستیک ها در اکوسیستم های دریایی اخیراً به تفصیل بررسی شده و حضور میکروپلاستیک ها در محیط های دریایی توجه جهانی را به خود جلب کرده است. میکروپلاستیک ها جوامع بیوفیلم های میکروبی را که از محیط اطراف متمایز هستند، انتقال می دهند. اگرچه میکروارگانیسمهای کلونیزه شده روی میکروپلاستیک ها پلاستیک برای سرنوشت آنها در اکوسیستمهای مختلف مهم هستند، اما تأثیر آن بر سرنوشت آنها تا حد زیادی ناشناخته است. در این بررسی، ما بر ایجاد بیوفیلمهای خاص پلاستیکی (Plastisphere) تمرکز کردیم. غنی سازی باکتری های بیماری زا همراه با عملکردمیکروپلاستیک ها و تخریب میکروبی میکروپلاستیک ها در محیط دریایی، درک بهتری از گسترش پلاستیکره و بیوفیلم در محیطهای دریایی ارائه میدهد و در مورد تجزیه زیستی پلاستیک ها بحث میکند. همچنین، شناسایی بالقوه بیماریزا در پلاستی کره در نظر گرفته شده است. پرونده مقاله -
دسترسی آزاد مقاله
8 - تجزیه و تحلیل in silico پتانسیل ممانعت کنندگی داروهای ضد التهابی غیر استروئیدی اصلی علیه مسیر Las کروم سنسینگ در سودموناس آئروژینوزا
حسین زحمتکش بهنام راستیشماره 3 , دوره 1 , پاییز 1401ظهور مقاومت دارویی، شکست درمانی و توسعه عفونت های سودوموناس آئروژینوزا در درجه اول به تشکیل بیوفیلم و عوامل حدت وابسته به سیستم سنجش حد نصاب نسبت داده می شود. پتانسیل ضد میکروبی برخی از داروهای ضد التهاب غیر استروئیدی مانند ایبوپروفن در مطالعات آزمایشگاهی مشخص شده است چکیده کاملظهور مقاومت دارویی، شکست درمانی و توسعه عفونت های سودوموناس آئروژینوزا در درجه اول به تشکیل بیوفیلم و عوامل حدت وابسته به سیستم سنجش حد نصاب نسبت داده می شود. پتانسیل ضد میکروبی برخی از داروهای ضد التهاب غیر استروئیدی مانند ایبوپروفن در مطالعات آزمایشگاهی مشخص شده است. در اینجا، یک تجزیه و تحلیل داکینگ برای بررسی برهمکنش میان هفت داروی ضد التهاب غیر استروئیدی و پروتئین های سیستم Las انجام شد. در ابتدا، ساختار سه بعدی NSAID های منتخب (دیکلوفناک سدیم، ایبوپروفن، کتوپروفن، مفنامیک اسید، ملوکسیکام، ناپروکسن و تنوکسیکام) و لیگاند طبیعی LasR (3-oxo-C12-HSL) از پایگاه داده PubChem دریافت شد. همچنین ساختارهای کریستالی LasI Synthase و پروتئین فعال کننده رونویسی LasR از بانک داده پروتئین به دست آمد. سپس، تجزیه و تحلیل اتصال مولکولی با استفاده از نرم افزار AutoDock Vina برای بررسی توانایی NSAID های انتخاب شده برای مهار گیرنده LasI/LasR مورد استفاده قرار گرفت. بر اساس یافتههای ما، اکثر NSAIDهای انتخاب شده برهمکنشهای مطلوبی با پروتئینهای LasI/R نشان دادند. علاوه بر این، کتوپروفن قویترین برهمکنشها را با هر دو پروتئین نشان داد. به طور خلاصه، این کار نشان می دهد که NSAID ها، به ویژه کتوپروفن و ناپروکسن، پتانسیل امیدوارکننده ای به عنوان کاندید برای تحقیقات بیشتر آزمایشگاهی و درون تنی برای مهار مدارهای کروم سنسینگ در سودوموناس آئروژینوزا را دارند پرونده مقاله -
دسترسی آزاد مقاله
9 - مروری بر متابولیت های ثانویه میکروب ها برای کنترل بیماری ها
بهاره نوروزی نگین خشنود سارا سوری سوگل قارونی فرد محمد رضا رضایی فاطمه السادات ایوب نژاد ندا فرهودی فردشماره 3 , دوره 1 , پاییز 1401خطر قابل توجه عفونت های باکتریایی برای سلامت مردم در سراسر جهان، منجر به توسعه برنامه های بهداشت جهانی شده است. طی دهه های گذشته، مقاومت دارویی باکتریایی افزایش یافته است، در حالی که کشف آنتی بیوتیک های جدید به طور مداوم روندی نزولی داشته است. به همین دلیل امروزه جستجو چکیده کاملخطر قابل توجه عفونت های باکتریایی برای سلامت مردم در سراسر جهان، منجر به توسعه برنامه های بهداشت جهانی شده است. طی دهه های گذشته، مقاومت دارویی باکتریایی افزایش یافته است، در حالی که کشف آنتی بیوتیک های جدید به طور مداوم روندی نزولی داشته است. به همین دلیل امروزه جستجو برای عوامل ضد باکتری جدید به اولویت اصلی تبدیل شده است و در نتیجه، داروهای جایگزین و روش های جدیدی برای تولید محصولات میکروبی توسعه یافته است. به کمک ویرایش ژن و توالی یابی NGS، پتانسیل ژنتیکی بی نظیری برای ایجاد متابولیت های ثانویه توسط میکروارگانیسم های مختلف ایجاد شده است. متابولیت های ثانویه نقش مهمی در رشد سلولی، انتقال سیگنال، ارتباطات، رقابت درون گونه ای و بین گونه ای و تولید ترکیبات آلی با جرم مولکولی کم دارند. بنابراین، توجه بسیاری از محققان را برای جایگزین کردنشان با آنتی بیوتیک های معمولی،جلب کرده است. به محض اینکه باکتری ها نسبت به آنتی بیوتیک های نسل اول مقاوم شدند، درمان باید به آنتی بیوتیک های نسل دوم یا سوم تغییر یابد. بنابر این دست یابی به ترکیبات نوآورانه و قدرتمند با پتانسیل ضد سرطانی بالا و مطلوب نیازی جدی است؛ با این حال، اکثر داروهای ضد سرطانی استفاده شده در حال حاضر عوارض جانبی دارند. هدف از این مقاله مروری ارزیابی استفاده از انواع مختلف متابولیتهای ثانویه میکروبی برای پیشگیری و درمان بیماریهای عفونی با بررسی هزینهها، مزایا، معایب و عوارض جانبی آنها است. پرونده مقاله -
دسترسی آزاد مقاله
10 - اثر عصاره های گیاه گیجاواش بر سویه محیطی انتروکوکوس فکالیس و رده سلولی هلا
فاطمه شمس معطر میرساسان میرپور نغمه همتیشماره 2 , دوره 1 , تابستان 1401Pimpinella saxifraga تیره ای از گیاهان معطر بومی شمال ایران است. برخی از فواید دارویی آن در حال حاضر شناخته شده است. هدف از این مطالعه بررسی اثر عصاره گیاه Pimpinella saxifraga L بر روی برخی از جدایه های محیطی انتروکوکوس فکالیس و رده سلولی HeLa می باشد. پس از جمع آوری گ چکیده کاملPimpinella saxifraga تیره ای از گیاهان معطر بومی شمال ایران است. برخی از فواید دارویی آن در حال حاضر شناخته شده است. هدف از این مطالعه بررسی اثر عصاره گیاه Pimpinella saxifraga L بر روی برخی از جدایه های محیطی انتروکوکوس فکالیس و رده سلولی HeLa می باشد. پس از جمع آوری گیاه و خشک شدن آن، عصاره های متانولی و آبی تهیه شد. از آنجایی که ترکیبات فنلی دارای اثرات متعددی هستند، تعداد ترکیبات فنلی موجود در عصاره متانولی به روش Folin-ciocalteu اندازه گیری شد. فعالیت ضد باکتریایی علیه E. faecalis ابتدا با دیسک دیفیوژن و سپس MIC و MBC با روش Microdilution اندازه گیری شد. در نهایت، فعالیت ضد تکثیری عصاره های گیاهی بر روی رده سلولی سرطان دهانه رحم (HeLa) با استفاده از روش MTT مورد بررسی قرار گرفت. حجم ترکیبات فنلی عصاره متانولی 968.33 میلی گرم بر میلی لیتر بود. بررسی اثر ضد میکروبی نشان داد که عصاره متانولی اثرات قابل توجهی بر باکتری E. faecalis دارد. MIC و MBC این عصاره به ترتیب 25 و 100 میلی گرم بر میلی لیتر بود و با استفاده از غلظت MIC از رشد رده سلولی سرطان دهانه رحم (HeLa) حدود 13 درصد مهار شد. نتایج آزمایشها نشان داد که عصاره متانولی P. saxifraga L اثر مهاری بر رشد و تکثیر Enterococcus faecalis و رده سلولی HeLa دارد. پرونده مقاله