سابقه و هدف: پروتئین جدیدی تحت عنوان پروتئینF یاcore+1 شناخته شده است که توسط ژنوم ویروس هپاتیت C (HCV) کد می‌شود. عملکرد این پروتئین هنوز مشخص نشده است، اما به‌نظر می‌رسد در سیکل زندگی و بیماری‌زایی ویروس قش مهمی را داشته باشد. در این مطالعه کلون کر چکیده کامل
سابقه و هدف: پروتئین جدیدی تحت عنوان پروتئینF یاcore+1 شناخته شده است که توسط ژنوم ویروس هپاتیت C (HCV) کد می‌شود. عملکرد این پروتئین هنوز مشخص نشده است، اما به‌نظر می‌رسد در سیکل زندگی و بیماری‌زایی ویروس قش مهمی را داشته باشد. در این مطالعه کلون کردن و بیان ژن HCV core+1 در سیستم یوکاریوتی مورد بررسی قرار گرفت تا نقش این پروتئین در مسیرهای سیگنالینگ سلولی و مقاومت ویروس به درمان بررسی گردد. مواد و روش‌ها: ابتدا ژن core+1 داخل پلاسمید pIVEX2.3 به‌عنوان یک ناقل پروکاریوتی کلون شد. در ادامه توالی نوکلئوتیدی 6XHis-tag core+1 حاصل از واکنش زنجیره‌ای پلی‌مراز (PCR) در سایت‌های آنزیمی NheI/BamHI داخل وکتور یوکاریوتی pcDNA3.1(+) کلون شد. این پلاسمید به‌وسیله تجزیه آنزیمی و توالی‌یابی مورد تائید قرار گرفت. پس از ساخته شدن رده سلول کبدی Huh7 به وسیله روش الکتروپوریشن و لیپوفکشن ترانسفکت شدند. با ترانسفکشن هم‌زمان پلاسمید pEGFP-N1 و با تکنیک فلوسایتومتری بازده ترانسفکشن مورد بررسی قرار گرفت. در نهایت بیان و چگونگی استقرار پروتئین core+1 در سلول توسط میکروسکوپ هم‌کانون ارزیابی شد. یافته‌ها: نتایج هضم آنزیمی و تعیین توالی صحت مراحل کلونینگ را نشان داد. آنالیز فلوسایتومتری بازده بالای روش الکتروپوریشن را در مقایسه با لیپوفکشن برای ترانسفکشن سلول‌های Huh7 نشان داد. هم‌چنین بیان پروتئین core+1 در سلول‌های Huh7 با استفاده از آنتی‌بادی anti-His و میکروسکوپ هم‌کانون مورد تائید قرار گرفت. نتیجه گیری: نتایج این پژوهش بیان یوکاریوتی پروتئین core+1 در سلول‌های Huh7 را نشان داد که به این ترتیب می تواند که ابزار مناسبی را برای مطالعه نقش تداخلی پروتئین در مسیرهای سیگنالینگ سلولی و برهم‌کنش آن با سایر پروتئین‌ها در اختیار ما قرار دهد.
پرونده مقاله
سابقه و هدف: با وجود کنترل بیماری سرخک در جهان، اما گزارش‌هایی از ابتلا به این ویروس در جمعیت‌های واکسینه شده وجود دارد. بنابراین تشخیص دقیق و به‌موقع این ویروس ضروری است. روش‌های جدید مولکولی در تشخیص ویروس ارائه شده است که توان تعیین مقدار این ویرو چکیده کامل
سابقه و هدف: با وجود کنترل بیماری سرخک در جهان، اما گزارش‌هایی از ابتلا به این ویروس در جمعیت‌های واکسینه شده وجود دارد. بنابراین تشخیص دقیق و به‌موقع این ویروس ضروری است. روش‌های جدید مولکولی در تشخیص ویروس ارائه شده است که توان تعیین مقدار این ویروس را ندارند. هدف از این پژوهش راه اندازی روش Real-time PCR با استفاده از ژن F ویروس سرخک می‌باشد. مواد و روش‌ها: این مطالعه با طراحی دو پرایمر و یک پروب راه اندازی و از ژن F کلون شده در داخل پلاسمید pET-22b(+) استفاده گردید. رقت‌های متوالی در مبنای 10 از پلاسمید استاندارد حاوی ژن آماده شد و منحنی استاندارد رسم گردید. جهت انجام پروژه از کیت Taq Man ساخت شرکت ABI استفاده گردید. یافته‌ها: حداقل 30 ذره ویروسی در هر واکنش مشخص گردید و در محدوده رقت‌های 4-10تا 9- 10 معادل ( 101×3- 106×3) نسخه بهترین حالت خطی برای منحنی استاندارد دیده شد. نتیجه گیری: نتایج نشان داد که تکنیک Real-time PCR می‌تواند به عنوان روشی بسیار اختصاصی و سریع برای تشخیص و تعیین تعداد ویروس سرخک از نمونه‌های حاوی این ویروس به‌کار رود.
پرونده مقاله
زمینه و هدف: کریپتوکوکوس نئوفورمنس بیشتر افراد دچار نقص سیستم ایمنی را درگیر می‌کند و مننژیت حالت شایع بیماری می‌باشد. روش‌های متعددی برای تشخیص این عامل کشنده رایج است اما هیچ‌کدام از این روش‌ها، حساسیت، اختصاصیت و سرعت قابل قبولی را ندارند. LA چکیده کامل
زمینه و هدف: کریپتوکوکوس نئوفورمنس بیشتر افراد دچار نقص سیستم ایمنی را درگیر می‌کند و مننژیت حالت شایع بیماری می‌باشد. روش‌های متعددی برای تشخیص این عامل کشنده رایج است اما هیچ‌کدام از این روش‌ها، حساسیت، اختصاصیت و سرعت قابل قبولی را ندارند. LAMP یک روش مقرون به‌صرفه در عین حال بسیار سریع و حساس و سودمند به‌ویژه در کشورهای در حال توسعه می‌باشد. در این مطالعه سعی بر راه اندازی و بهینه نمودن LAMP برای تشخیص وارزیابی میزان شیوع کریپتوکوکوس نئوفورمنس در نمونه‌های سرمی بیماران مبتلا به ایدز شده است. مواد و روش‌ها: تعداد 34 نمونه سرم خون از بیماران فوق جمع آوری گردید. آزمون‌های حساسیت و اختصاصیت بر روی روش انجام و آزمون بر روی نمونه‌ها بهینه گردید. پس از انجام مراحل غیرفعال‌سازی عوامل عفونی موجود درنمونه‌ها و استخراج DNA، از تعداد 6 پرایمر طراحی شده ویژه ژن ura5 ، برای به‌کارگیری آزمون LAMP در تشخیص کریپتوکوکوس نئوفورمنس استفاده شد. یافته‌ها: تعداد 3 مورد از 34 نمونه جمع آوری شده با استفاده از LAMP مثبت گزارش گردید. حساسیت و اختصاصیت این روش 100% ارزیابی شد. نتیجه‌گیری: LAMP روشی کاربردی، حساس، سریع و مقرون به‌صرفه در تشخیص کریپتوکوکوس نئوفورمنس، می‌باشد. استفاده از این روش که برای اولین بار در ایران انجام شده است، در آزمایشگاه‌های تشخیص طبی با داشتن کم‌ترین تجهیزات قابل انجام است.
پرونده مقاله
سابقه و هدف: لیستریا باکتری است که انتشار وسیعی در طبیعت دارد و معمولاً در خاک، فاضلاب، گرد و غبار و آب یافت میشود. لیستریا مونوسیتوزنز و سایر گونه های لیستریا از طیف وسیعی از غذاهای خام و آماده مصرف جداسازی شده اند. هدف از این پژوهش، تعیین میزان شیوع گونههای لیستریا چکیده کامل
سابقه و هدف: لیستریا باکتری است که انتشار وسیعی در طبیعت دارد و معمولاً در خاک، فاضلاب، گرد و غبار و آب یافت میشود. لیستریا مونوسیتوزنز و سایر گونه های لیستریا از طیف وسیعی از غذاهای خام و آماده مصرف جداسازی شده اند. هدف از این پژوهش، تعیین میزان شیوع گونههای لیستریا در نمونههای شیر خام ، پنیر و بستنی سنتی عرضه شده در شهرستان شهرکرد و شیراز بود. مواد و روش ها: در این پژوهش، 178 نمونه شیر خام گاو (45)، شیر خام بز (32)، پنیر سنتی (41) و بستنی سنتی (60) به طور تصادفی جمعآوری گردید. تمامی نمونه ها از نظر وجود گونه های لیستریا به روش استاندارد مورد آزمایش قرار گرفتند. گونه های لیستریا جدا شده با استفاده از روش واکنش زنجیره ای پلی مراز تائید شدند. یافته ها: بر پایه آزمونهای میکروب‌شناسی از مجموع 178 نمونه مورد بررسی، 24 نمونه (5/13 درصد) از نظر آلودگی به گونههای لیستریا مثبت شناخته شدند. شیوع گونههای لیستریا در شیر خام گاو، شیر خام گوسفند، پنیر سنتی و بستنی سنتی به ترتیب 1/11%، 1/3%، 4/24% و 3/13% بود. در این پژوهش بیشترین گونه جداسازی شده لیستریا اینوکوا (5/62%) و در بقیه موارد لیستریا منوسایتوژنز (5/37 درصد) شناسایی گردید. نتیجه گیری: نتایج این مطالعه خطر بالقوه عفونت ناشی از مصرف شیر خام و فرآورده های لبنی غیر پاستوریزه را به لیستریا نشان میدهد. مطالعات بیشتر در زمینه وضعیت الودگی به این پاتوژن در سایر مواد غذایی به ویژه مواد غذایی آماده مصرف پیشنهاد می شود.
پرونده مقاله
سابقه و هدف: کلامیدیا پسی تاسی یک باکتری گرم منفی درون سلولی است که باعث کلامیدیوزیس مرغی، شیوع بیماری‌های همه‌گیر در پستانداران و پسیتاکوز تنفسی در انسان‌ها می‌شود. کبوتران مانند بسیاری از گونه‌های پرندگان دیگر می‌توانند مخزن کلامیدیا پسی& چکیده کامل
سابقه و هدف: کلامیدیا پسی تاسی یک باکتری گرم منفی درون سلولی است که باعث کلامیدیوزیس مرغی، شیوع بیماری‌های همه‌گیر در پستانداران و پسیتاکوز تنفسی در انسان‌ها می‌شود. کبوتران مانند بسیاری از گونه‌های پرندگان دیگر می‌توانند مخزن کلامیدیا پسی‌تاسی باشند و سبب انتقال آن به انسان شوند. هدف از این پژوهش تعیین فراوانی کلامیدیا پسی‌تاسی در مدفوع کبوتران استان چهارمحال و بختیاری با استفاده از روش مولکولی واکنش زنجیره‌ای پلیمراز (PCR) بود. مواد و روش‌ها: در این مطالعه به صورت مقطعی - توصیفی، تعداد 300 نمونه مدفوع کبوتر از شهرستان‌های مختلف استان چهارمحال و بختیاری جمع آوری شد. DNA ژنومی از نمونه‌ها با استفاده از کیت استخراج گردید و واکنش PCR با استفاده از پرایمرهای مخصوص برای ژن OmpA کلامیدیا پسی‌تاسی انجام شد. یافته‌ها: بررسی محصولات PCR روی ژل آگارز 1 درصد یک باند 1041 جفت بازی برای نمونه‌های مثبت نشان داد. فراوانی کلامیدیا پسی‌تاسی در این مطالعه 33/14% گزارش گردید. هم‌چنین بیشترین و کم‌ترین فراوانی عفونت به این باکتری به ترتیب در شهرستان‌های کیار و لردگان با 66/16 و 8% مشاهده شد و اختلاف معنی داری در فراوانی این باکتری در شهرستان‌های مختلف استان مشاهده نگردید (05/0< p). نتیجه‌گیری: نتایج مطالعه حاضر نشان داد که کلامیدیا پسی‌تاسی در میان کبوتران استان چهارمحال و بختیاری شایع است. معاینه کبوتران و پرندگان خانگی، برای کنترل و جلوگیری از انتشار این عامل بیماری‌زا لازم به‌نظر می‌رسد. همچنین با کنترل این بیماری می‌توان از زیان‌های اقتصادی و خطرات بهداشتی ناشی از آن نیز جلوگیری کرد.
پرونده مقاله
سابقه و هدف: اسهال در گوساله‌های تازه متولد شده در نتیجه عفونت با اشریشیا کلی انتروتوکسیژن K99 یکی از معضلات مهم صنعت دام‌پروری است. هدف از این پژوهش، تعیین فراوانی و حساسیت آنتی بیوتیکی اشریشیا کلی K99 جدا شده از گوساله های مبتلا به اسهال در استان فارس بود. چکیده کامل
سابقه و هدف: اسهال در گوساله‌های تازه متولد شده در نتیجه عفونت با اشریشیا کلی انتروتوکسیژن K99 یکی از معضلات مهم صنعت دام‌پروری است. هدف از این پژوهش، تعیین فراوانی و حساسیت آنتی بیوتیکی اشریشیا کلی K99 جدا شده از گوساله های مبتلا به اسهال در استان فارس بود. مواد و روش‌ها: 312 نمونه سواب رکتوم از گوساله‌های مبتلا به اسهال در نقاط مختلف استان فارس تهیه و با روش‌های استاندارد باکتریولوژی سعی در جداسازی و شناسایی اشریشیا کلی K99 انجام شد. سپس برای کلیه جدایه‌های اشریشیا کلی به‌دست آمده تست حساسیت آنتی‌بیوتیکی به روش انتشار دیسک انجام شد. یافته‌ها: از مجموع نمونه‌های مورد مطالعه 298 جدایه اشریشیا کلی به‌دست آمد که از آن میان به روش اسلاید اگلوتیناسیون 13 جدایه اشریشیا کلی K99 تعیین هویت شدند. جدایه‌های اشریشیا کلی K99 به آنتی‌بیوتیک‌های انروفلوکساسین، نالیدیکسیک اسید و فلوموکوئین حساس بودند. اما مقاومت به طیف گسترده ای از آنتی بیوتیک ها در اشریشیا کلی های K99 و کمنسال وجود داشت. نتیجه گیری: شیوع اشریشیا کلی K99 در گوساله‌های دارای اسهال در استان فارس 3/4% تعیین گردید، که در مقایسه با دیگر گزارشات در طیف پایین قرار دارد.
پرونده مقاله
سابقه و هدف: بیماری‌های کلزا از مهم‌ترین دلایل محدود کننده تولید کلزا محسوب می‌گردند. در دنیا، عوامل قارچی متفاوتی مانند Rhizoctonia solani، Pytium sp.، Phytophthora sp. و Fusarium sp. دلیل پوسیدگی ریشه و مرگ گیاه‌چه معرفی شده‌اند. هدف از این پژ چکیده کامل
سابقه و هدف: بیماری‌های کلزا از مهم‌ترین دلایل محدود کننده تولید کلزا محسوب می‌گردند. در دنیا، عوامل قارچی متفاوتی مانند Rhizoctonia solani، Pytium sp.، Phytophthora sp. و Fusarium sp. دلیل پوسیدگی ریشه و مرگ گیاه‌چه معرفی شده‌اند. هدف از این پژوهش شناسایی عوامل قارچی مولد پوسیدگی ریشه و طوقه کلزا در شهرستان مرودشت و تعیین گونه‌های غالب بیماری‌زا در سطح منطقه بود. مواد و روش‌ها: در این مطاله یکصد و هفت گیاه با علایم پوسیدگی ریشه و طوقه، از مزارع کلزای شهرستان مرودشت، جمع آوری و بررسی شد. جدایه‌ها، ابتدا روی محیط آب آگار ٢% با روش‌های استاندارد خالص‌سازی و با استفاده از کلید شناسایی گردیدند. آزمون اثبات بیماری‌زایی نیز برای جدایه‌های یاد شده انجام شد. یافته‌ها: در این پژوهش پنج گونه قارچ بیمارگر، متعلق به چهار جنس Fusarium، Rhizoctonia، Phoma و Pythium جداسازی گردید. F. solani با 25% و Phoma betae با 5/2% به‌ترتیب بیشترین و کم‌ترین فراوانی را در میان بیمارگرهای جدا شده نشان دادند. در آزمون اثبات بیماری‌زایی، R. solani شدت بیماری‌زایی بیشتر و P. aphanidermatum و F. solani شدت بیماری‌زایی کم‌تری را نشان دادند. نتیجه‌گیری: این اولین گزارش از وجود قارچ روی ریشه کلزا از استان فارس می‌باشد. با توجه به یافته‌های این پژوهش و محرز شدن آلودگی وسیع ریشه کلزا به solani .R پیشنهاد می‌شود در تحقیقی دیگر گروه آناستوموزی این جدایه‌ها مورد بررسی قرار گیرد.
پرونده مقاله
سابقه و هدف: باکتری‌های ریزوبیوم مهم‌ترین میکروارگانیسم‌های موجود در خاک هستند که نسبت به سایر میکروب‌زیاگان خاک نقش بیشتری را در تثبیت ازت دارند. هدف از این پژوهش، استفاده از ریزوبیوم بومی استان فارس و نقش کود اوره در بهره‌وری گیاه یونجه بود. چکیده کامل
سابقه و هدف: باکتری‌های ریزوبیوم مهم‌ترین میکروارگانیسم‌های موجود در خاک هستند که نسبت به سایر میکروب‌زیاگان خاک نقش بیشتری را در تثبیت ازت دارند. هدف از این پژوهش، استفاده از ریزوبیوم بومی استان فارس و نقش کود اوره در بهره‌وری گیاه یونجه بود. مواد و روش‌ها: ابتدا ریزوبیوم بومی از گرهک‌های یونجه با استفاده از محیط YMA حاوی قرمز کنگو، جداسازی و با استفاده از رنگ‌آمیزی و تست‌های بیوشیمیایی تعیین هویت گردیدند. این پژوهش به صورت تصادفی و درنظر گرفتن فاکتور اول شامل: نوع کود، بدون اوره، 100 میلی‌گرم در کیلو گرم کود اوره، 200 میلی‌گرم در کیلوگرم کود اوره، 1 درصد کود حیوانی، 3 درصد کود حیوانی و فاکتور دوم شامل: بدون باکتری، ریزوبیوم محلی، ریزوبیوم سوش استاندارد در شش تکرار در هوای آزاد انجام گردید. یافته‌ها: بیشترین رشد در گلدان‌هایی که با ریزوبیوم بومی تیمار شده مشاهده گردید. در مقایسه با کود اوره و کود حیوانی بهترین رشد در تیمار کود حیوانی 3 درصد و بیشترین ارتفاع گیاه در گلدان‌هایی با تیمار ریزوبیوم بومی دیده شد. همچنین بهترین تیمار استفاده از ریزوبیوم سوش محلی و کود حیوانی 3 درصد برای محصول‌دهی بیشتر بود. بیشترین گرهک‌های فعال در تثبیت ازت در گیاهانی با تیمار ریزوبیوم بومی مشاهده گردید. نتیجه گیری: در مقایسه بین ریزوبیوم بومی و سوش استاندارد و با توجه به آهکی بودن خاک‌های استان و آب و هوای گرم و خشک منطقه استفاده از ریزوبیوم بومی و کود حیوانی می‌تواند باعث بهره‌وری بیشتر و تثبیت ازت توسط گرهک‌های تولید شده برروی ریشه گیاه گردد. هم‌چنین می‌توان در تولید کود‌های بیولوژیک از ریزوبیوم‌های جداسازی شده از مناطق مختلف با هدف محصول دهی بیشتر استفاده نمود. استفاده از کود حیوانی به‌دلیل تجزیه طولانی مدت و فعال کردن دیگر باکتری‌های آزادزی تثبیت کننده ازت می‌تواند به رشد گیاه کمک شایانی نماید.
پرونده مقاله