تعیین تنوع ژنتیکی قارچ Fusarium oxysporum f. sp. ciceri عامل پژمردگی آوندی نخود ایرانی در استان ایلام با استفاده از نشانگرهای ISSR
محورهای موضوعی : دو فصلنامه تحقیقات بیماریهای گیاهی
مریم عظیمی
1
(دانش آموخته کارشناسی ارشد، گروه بیماری شناسی گیاهی، واحد علوم و تحقیقات تهران، دانشگاه آزاد اسلامی، تهران، ایران.)
سعید رضائی
2
(استادیار، گروه بیماری شناسی گیاهی، واحد علوم و تحقیقات تهران، دانشگاه آزاد اسلامی، تهران، ایران.)
سیامک بیگی
3
(استادیار، سازمان جهاد کشاورزی استان ایلام، ایلام، ایران.)
کلید واژه: تنوع ژنتیکی, Fusarium oxysporum f. sp. ciceri, نشانگرریز ماهواره ISSR,
چکیده مقاله :
بیماری پژمردگی فوزاریومی نخود ایرانی ناشی از قارچ Fusarium oxysporum f.sp. ciceri یکی از مهمترین بیماریهای این محصول در ایران می باشد. به منظور بررسی تنوع ژنتیکی این بیمارگر تعداد 47 جدایه از مناطق آلوده استان ایلام جداسازی و مورد بررسی قرار گرفت. پس از استخراج DNA بررسی تنوع ژنتیکی این جدایهها با استفاده از نشانگرهای مولکولی ISSR صورت گرفت. بر اساس نتایج حاصله در سطح ضریب تشابه 64%، جدایه ها در 24 گروه قرار گرفتند. این نتیجه نشان دهنده تنوع ژنتیکی بالا در بین جدایههای قارچ در استان ایلام است. بر اساس اطلاعات بدست آمده از آغازگرهای ISSR در بین شش جمعیت مورد مطالعه بیشترین فاصله ژنتیکی (054/0) بین جمعیت های سرابله و سیروان و کمترین فاصله ژنتیکی (010/0) بین جمعیت های آسمان آباد و شباب دیده شد. جریان ژنی و تمایز ژنتیکی با نرمافزار Pop GEN نشان داد که بیشترین جریان ژنی مربوط به ISSR5 با مقدار 27/18 و کمترین میزان جریان ژنی مربوط به ISSR7 با مقدار 65/1 بود و متوسط جریان ژنی 60/4 محاسبه شد. متوسط تمایز ژنتیکی در این تحقیق 098/0 بود. واریانس ژنتیکی محاسبه شده در بین جمعیتها 6% و در میان جمعیتها 94% بود. تنوع ژنتیکی بالا بین و درون جمعیتها نشان دهنده احتمال توانایی بیماریزایی متفاوت در آنها است. این موضوع نشان دهنده اهمیت شناسایی نژادهای غالب بیمارگر در منطقه و به کارگیری آنها در فرآیند معرفی ارقام مقاوم به این بیماری می باشد.
Fusarium wilt disease of Iranian chickpea caused by Fusarium oxysporum f.sp. ciceri fungus is one of the most important chickpea diseases in Iran. In order to study the genetic diversity of this pathogen, 47 isolates were collected from infected areas in Ilam province. After extracting DNA, the genetic diversity of these isolates was analyzed using ISSR molecular markers. Based on the results at the level of 64% similarity coefficient, isolates were clustered into 24 groups. This result demonstrates the high genetic diversity among the isolates in Ilam province. Based on information obtained from ISSR primers were among six studied populations, the highest genetic distance was found to be 0.054 between Sarableh and Sirvan populations and the lowest genetic distance as 0.010 between Asemanabad and Shabab populations. Gene flow and genetic differentiation using Pop GEN software showed that gene flow is related to ISSR5 with its amount as 18.27 and the lowest value was related to ISSR7 with its amount as 1.65 and the mean gene flow was calculated as 4.60. In this research, the mean flow was 0.098. The calculated genetic variance was 6% between the populations and as well as to be 94% in populations. High genetic variation between and among populations shows the potential different aggressiveness of isolates. This shows the importance of the dominant pathotype(s) identification in the region as well as using them in the process of introduction new resistant cultivars.
_||_