بررسی بیوانفورماتیکی FLORICAULA (FLO) در گیاه زینتی بنفشه آفریقایی (Saintpaulia ionantha H.Wendl.)
محورهای موضوعی : زیست شناسی سلولی تکوینی گیاهی و جانوری ، تکوین و تمایز ، زیست شناسی میکروارگانیسممینا کاظمیان 1 * , الهام محجل کاظمی 2 , مریم کلاهی 3 , ولی اله قاسمی 4
1 - گروه گیاهی، دانشکده علوم طبیعی، دانشگاه تبریز، تبریز، ایران.
2 - گروه گیاهی، دانشکده علوم طبیعی، دانشگاه تبریز، تبریز، ایران.
3 - گروه زیست‌شناسی، دانشکده علوم، دانشگاه شهید چمران اهواز، اهواز، ایران
4 - پژوهشکده ژنتیک و زیست‌فناوری طبرستان، ساری، مازندران، ایران.
کلید واژه:
چکیده مقاله :
گذر مرحله رویشی به زایشی در گیاه زینتی بنفشه آفریقایی با نام علمی Saintpaulia ionantha H.Wendlبا کنترل فاکتورهایی از جمله FLORICAULA (FLO) صورت می‌گیرد. فرآیند تعیین سرنوشت مریستم گل و الگوی شکل‌گیری آن توسط ژن FLO و القای ژن‌های همئوتیک مشخص می‌شود. در این پژوهش تعیین توالی پروتئین FLO، ویژگی‌های پروتئینی، ساختار دوم، موقعیت درون-سلولی و درخت فیلوژنتیکی توسط ابزارهای بیوانفورماتیک برای نخستین‌بار در بنفشه آفریقایی مورد ارزیابی قرارگرفته است. نتایج نشان داد که موقعیت درون سلولی این پروتئین در هسته پیش بینی شده است. این پروتئین (FLO) به خانواده FLO/LFY تعلق دارد. ساختار ثانویه پروتئین 53% آلفا هلیکس و 4% صفحات بتا تشکیل شده است. بررسی درخت فیلوژنی، گونه‌های مربوط به یک خانواده در یک شاخه جای گرفتند. همچنین هم‌ترازی توالی پروتئین نشان داده است که در گیاهان هم‌خانواده توالی به‌شدت حفاظت شده است. شناسایی ویژگی‌های پروتئین FLO می‌تواند به عنوان فاکتور اصلی در برنامه‌ریزی عملکرد بافت و به دنبال آن کنترل عملکرد این پروتئین حائز اهمیت باشد.
The transition from vegetative to reproductive stage in Saintpaulia ionantha H.Wendl is controlled by factors such as FLORICAULA (FLO). The process of determining the fate of the flower meristem and its formation pattern is determined by the FLO and the induction of homeotic regulators. In this research, FLO sequencing, protein characteristics, secondary structure, intracellular position and phylogenetic tree have been evaluated by bioinformatics tools for the first time in African violet. The results showed that the intracellular location of this protein is predicted in the nucleus. This protein (FLO) belongs to the FLO/LFY family. The secondary structure of the protein consists of 53% alpha helix and 4% beta sheets. Examining the phylogeny tree, species related to one family were placed in one branch. Also, protein sequence alignment has shown that the sequence is highly conserved in plants of the same family. Identifying the characteristics of FLO protein can be important as the main factor in planning the function of the tissue and then controlling the function of this protein.