بررسی تغییرات بیانmiR-1193 در نمونه های بافت بیماران مبتلا به گلیوبلاستوما مولتی فرم
محورهای موضوعی :
فصلنامه زیست شناسی جانوری
علی حسین یزدی
1
,
الهام مسلمی
2
,
وجیهه زرین پور
3
,
محمد مهدی فرقانی فرد
4
1 - گروه زیست شناسی، واحد دامغان، دانشگاه آزاد اسلامی، دامغان، ایران
2 - گروه زیست شناسی، واحد دامغان، دانشگاه آزاد اسلامی، دامغان، ایران
3 - گروه زیست شناسی، واحد دامغان، دانشگاه آزاد اسلامی، دامغان، ایران
4 - گروه زیست شناسی، واحد دامغان، دانشگاه آزاد اسلامی، دامغان، ایران
تاریخ دریافت : 1399/06/10
تاریخ پذیرش : 1399/08/12
تاریخ انتشار : 1400/09/01
کلید واژه:
سرطان,
بیان ژن,
گلیوبلاستوما مولتی فرم,
miR-1193,
چکیده مقاله :
گلیوبلاستوما مولتی فرم یکی از بدخیم ترین سرطان ها می باشد که با توجه به دشوار بودن تشخیص زود متاسفانه اکثر بیماران طی یک سال بعد از تشخیص می میرند.RNA های غیرکدکننده نوعی از RNAها هستند که هیچ پروتئینی را رمزگذاری نمی کنند و به عنوان تنظیم کنندهای پس از رونویسی در بیان ژن عمل کرده و می توانند نقش مهمی را تشخیص سرطان داشته باشند. هدف از این مطالعه بررسی تغییرات بیان miR-1193 و ارتباط آن با گرید، سن و جنسیت می باشد. در این مطالعه تغییرات بیان miR-1193 را در 50 نمونه بافت مبتلا به گلیوبلاستوما مولتی فرم در مراحل مختلف بیماری و 50 نمونه نرمال با تکنیکReal-Time PCR که برای آنالیز میزان بیان ژن های مورد مطالعه می باشد و از GraphPad Prism 8 برای آنالیز آماری استفاده شد همچنین با اسفاده از منحنیRoc ارزش بیومارکی زیستی آن مورد ارزیابی قرار گرفت. نتایج حاصل از این مطالعه نشان داد سطح بیانmiR-1193 افزایش بیان را در نمونه های بیماران مبتلا به گلیوبلاستوما مولتی فرم نسبت به نمونه های سالم نشان داد. همچنین بیان ژن mir11933-5p از لحاظ آماری با Grade و سن و جنسیت بیمار ارتباط معنی دار نداشت. با آنالیز منحنی و تعیین مقدار cut-off برای این بیومارکر، مشخص گردید که میزان off-cut برابر با 141/5 برای miR-1193بود که بیماران را با اختصاصیت 1 و حساسیت 78/0 می تواند تشخیص دهد. اما با توجه به میزان حساسیت به نسبت پایین آن باید بررسی بیشتری صورت بگیرد.
چکیده انگلیسی:
Glioblastoma is one of the most malignant cancers worldwide, which due to the difficulty of early diagnosis, most affected people die within a year after diagnosis. Non-coding RNAs are a group of RNAs acting as post-transcriptional regulators and can play an essential role in cancer diagnosis. This study was aimed at investigating the expression level of miR-1193 in glioblastoma multiform and normal tissue samples and their correlation with the grade, age, and sex parameters. In this study, the expression level of miR-1193 was quantified in 50 glioblastoma multiform tissues (at different stages of disease), and 50 normal ones using the Real-Time PCR technique. GraphPad Prism 8 software was used for statistical analysis. The results of this study revealed down-regulation of the miR-1193 glioblastoma multiform samples compared to normal ones. The expression of miR-1193 was not significantly correlated with grade, age, and sex parameters. Finally, increased expression of miR-1193 could play an essential role in glioblastoma multiform. Moreover, according to Roc curve analysis and determining the cut-off value for this biomarker, it was found that the off-cut value was equal to 5.141 for miR-1193, which can detect patients with specificity of 1 and sensitivity of 0.78. However, due to its relatively low sensitivity, more research should be conducted.
منابع و مأخذ:
Chen Z., Wu C., Li X., Zhang X., Huang L. 2018. MiR-1193 Inhibits Glioma Cells Proliferation, Migration, and Invasion via Targeting IGF2BP2. Journal of Biomaterials and Tissue Engineering, 8(11): 1558-1565
Geisler A., Schön C., Größl T., Pinkert S., Stein E.A., Kurreck J., Vetter R., Fechner H. 2013. Application of mutated miR-206 target sites enables skeletal muscle-specific silencing of transgene expression of cardiotropic AAV9 vectors. Molecular Therapy, 21(5): 924-933.
Gholampour S., Gholampour H. 2020. Correlation of a new hydrodynamic index with other effective indexes in Chiari I malformation patients with different associations. Scientific Reports, 10(1): 1-3.
Gholampour S. 2018. FSI simulation of CSF hydrodynamic changes in a large population of non-communicating hydrocephalus patients during treatment process with regard to their clinical symptoms. Plos One, 13(4): e0196216.
Hou X., Wen J., Ren Z., Zhang G. 2017. Non-coding RNAs: new biomarkers and therapeutic targets for esophageal cancer. Oncotarget, 8(26): 43571
Johnson S.M., Grosshans H., Shingara J., Byrom M., Jarvis R., Cheng A., Labourier E., Reinert K.L., Brown D., Slack F.J. 2005. RAS is regulated by the let-7 microRNA family. Cell, 120(5): 635-647.
Kuçi S., Rettinger E., Voß B., Weber G., Stais M., Kreyenberg H., Willasch A., Kuçi Z., Koscielniak E., Klöss S., von Laer D. 2010. Efficient lysis of rhabdomyosarcoma cells by cytokine-induced killer cells: implications for adoptive immunotherapy after allogeneic stem cell transplantation. Haematologica, 95(9): 1579-1586.
Li W., Qi Z., Wei Z., Liu S., Wang P., Chen Y., Zhao Y. 2015. Paeoniflorin inhibits proliferation and induces apoptosis of human glioma cells via microRNA-16 upregulation and matrix metalloproteinase-9 downregulation. Molecular Medicine Reports, 12(2): 2735-2740.
Li X., Li Y., Lu H. 2017. MiR-1193 suppresses proliferation and invasion of 12targeting IGF2BP2. Oncology Research Featuring Preclinical and Clinical Cancer Therapeutics, 25(4): 579-585.
Liu L.Z., Li C., Chen Q., Jing Y., Carpenter R., Jiang Y., Kung H.F., Lai L., Jiang B.H. 2011. MiR-21 induced angiogenesis through AKT and ERK activation and HIF-1α expression. PloS One, 6(4): e19139.
Mortazavi D., Sharifi M. 2018. Antiproliferative effect of upregulation of hsa-let-7c-5p in human acute erythroleukemia cells. Cytotechnology, 70(6): 1509-1518.
Naghibzadeh M., Gholampour S., Naghibzadeh M., Sadeghian‐Nodoushan F., Nikukar H. 2020. The effect of electromagnetic field on decreasing and increasing of the growth and proliferation rate of dermal fibroblast cell. Dermatologic Therapy, 11:e13803.
Ohgaki H., Dessen P., Jourde B., Horstmann S., Nishikawa T., Di Patre P.L., Burkhard C., Schüler D., Probst-Hensch N.M., Maiorka P.C., Baeza N. 2004. Genetic pathways to glioblastoma: a population-based study. Cancer research, 64(19): 6892-6899.
Ohgaki H., Kleihues P. 2007. Genetic pathways to primary and secondary glioblastoma. The American Journal of Pathology, 170(5):1445-1453.
Parsons D.W., Jones S., Zhang X., Lin J.C., Leary R.J., Angenendt P., Mankoo P., Carter H., Siu I.M., Gallia G.L., Olivi A. 2008. An integrated genomic analysis of human glioblastoma multiforme. Science, 321(5897): 1807-1812.
Röhn G., Koch A., Krischek B., Stavrinou P., Goldbrunner R., Timmer M. 2018. ACTB and SDHA are suitable endogenous reference genes for gene expression studies in human astrocytomas using quantitative RT-PCR. Technology in Cancer Research and Treatment, 17:1533033818802318
Sanghvi V.R., Mavrakis K.J., Van der Meulen J., Boice M., Wolfe A.L., Carty M., Mohan P., Rondou P., Socci N.D., Benoit Y., Taghon T. 2014. Characterization of a set of tumor suppressor microRNAs in T cell acute lymphoblastic leukemia. Science Signal, 7(352): ra111-.
Sedaghat Y., Gholampour S., Tabatabai Ghomshe F. 2019. Comparison of the effectiveness of manual cleaning, hydrogen peroxide vapour and ultraviolet-c in disinfection of hospital equipment. Infektološki Glasnik, 39(3):66-84.
Shabani M., Mohammad-Ganji S., Salahshourifar I. 2020. Investigation of Long Non-coding RNA HOX A11-AS Expression in Iranian Patients with Glioblastoma: A Quantitative Study. Journal of Qom University of Medical Sciences, 14(5): 22
Vemuganti R., Silva V.R., Mehta S.L., Hazell AS. 2014. Acute liver failure-induced hepatic encephalopathy is associated with changes in microRNA expression profiles in cerebral cortex of the rat. Metabolic brain disease. 29(4): 891-899.
Wang J., Li C., Xu L., Yang C., Zhang X. 2019. MiR-1193 was sponged by LINC00963 and inhibited cutaneous squamous cell carcinoma progression by targeting SOX4. Pathology-Research and Practice, 16: 152600
Wang J., Li C., Xu L., Yang C., Zhang X. 2019. MiR-1193 was sponged by LINC00963 and inhibited cutaneous squamous cell carcinoma progression by targeting SOX4. Pathology-Research and Practice, 215(10): 152600.
Zhang B., Lin Y., Bao Q., Zheng Y., Lan L. 2020. MiR-1193 Inhibits the Malignancy of Cervical Cancer Cells by Targeting Claudin 7 (CLDN7). Oncotargets and Therapy, 13: 4349-4358.
Zhou B., Chu M., Xu S., Chen X., Liu Y., Wang Z., Zhang F., Han S., Yin J., Peng B., He X. 2017. Hsa-let-7c-5p augments enterovirus 71 replication through viral subversion of cell signaling in rhabdomyosarcoma cells. Cell and Bioscience, 7(1): 7
_||_
